四倍体月季遗传连锁图谱的构建及部分观赏性状的QTLs分析

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月季(Rosa sp.)是蔷薇科(Rosaceae)蔷薇属(Rosa L.)的一个重要类群。因其姿态优美,色彩绚丽,用途众多等优点,被公认为重要的观赏植物之一。传统的育种工作存在很大的盲目性和不可预测性,而分子育种可以显著提高育种效率,加速育种进程。遗传连锁图谱的构建可为性状定位、分子标记辅助选择育种、功能基因克隆等提供技术平台,具有不可替代的作用。目前,蔷薇属中图谱的构建多集中在二倍体水平。然而在本属植物中,野生原种以及栽培品种的多倍体现象频发,现代月季品种绝大多数为四倍体。当在前人所构建的二倍体图谱上进行性状定位时,效率往往很低,品种改良进程依旧缓慢。因此,通过构建四倍体水平上高密度遗传连锁图谱并在此定位那些控制目标性状的基因,找到其中的遗传规律成为当务之急。本研究通过有目的性地杂交育种获得作图群体,筛选得到多态性高且稳定的分子标记,构建四倍体遗传连锁图谱,定位花瓣数量、花色等观赏性状,主要结论如下:1.筛选得到四倍体古老月季品种‘云蒸霞蔚’及四倍体现代月季品种‘太阳城’做为亲本,杂交育种得到遗传作图群体。随机挑选F1群体189个单株,利用AFLPs及SSRs,通过JoinMap 5.0软件构建遗传连锁图谱。图谱的初步构建将298个多态性位点定位于母本‘云蒸霞蔚’的26条连锁群上,295个多态性位点定位于父本‘太阳城’的32条连锁群上。2.构建了至今为止密度最高的月季四倍体遗传连锁图谱。‘云蒸霞蔚’及‘太阳城’图谱各自整合后分别覆盖基因组长度的737 cM及752 cM。两个亲本间图谱整合后,共计得到7个连锁群,295个多态性位点,覆盖基因组长度874 cM,标记间平均距离为2.9 cM。3.筛选得到了一系列多态性高的蔷薇属EST-SSRs,为今后分子标记辅助育种的展开提供了极大的帮助。研究中,通过EST序列开发设计SSR引物并在群体中扩增验证其多态性。在最终得到的整合图谱上分布有108对新开发的EST-SSRs,共计149个位点,占全部位点数量的约50%。4.通过2年共计5次对作图群体花期表型进行田间调查统计以及数据的处理分析,在最终的整合图谱上初步定位了与控制花瓣数量及花色相关的染色体区间9个,这为今后探讨相关观赏性状的遗传规律特别是与花色相关的基础研究提供了必要的支撑。在初始图谱上检测到的7个与控制花瓣数量相关联的QTLs能够解释表型变异率12.1%一68.7%。此外,定位得到的与花色(黄色或粉色)相关的QTLs位点,均能稳定地检测到且可靠性极高。通过189个单株以及多态性高的AFLPs、SSRs所构建的四倍体遗传连锁图谱为接下来图谱的进一步整合奠定了基础,为最终得到高密度的图谱提供了有力的支撑。另外通过对作图群体表型性状的追踪也为今后QTLs的精细定位及分子标记辅助选择育种提供了必要的帮助。
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