盐胁迫是作物生产中主要的非生物制约因素之一,严重威胁着粮食安全。盐碱地的开发和利用为解决粮食危机、保障粮食安全提供了新的思路。为了挖掘水稻耐盐基因,培育高耐盐水稻新品种,本研究以日本晴为轮回亲本,高耐盐水稻种质资源海稻86为供体亲本构建染色体片段代换系,通过对代换系进行不同发育时期耐盐性鉴定,挖掘新的耐盐基因或QTLs,并对鉴定到的耐盐基因或QTL开发分子标记。本研究结果为解析水稻耐盐的分子机制、创制耐盐水稻新种质、培育耐盐水稻新品种提供理论和材料基础。1.以日本晴为轮回亲本,高耐盐种质资源海稻86为供体亲本,构建了含有281个株系的染色体片段代换系一套,并利用146对多态分子标记对其进行了基因型鉴定,获得纯合代换株系106个,覆盖了水稻全基因组。2.对染色体片段代换系群体进行了种子萌发期、苗期、全生育期的耐盐性鉴定。种子萌发期筛选到7份比较耐盐的材料;幼苗期筛选到2份高耐盐株系;全生育期鉴定到78份比较耐盐的材料。另外,通过对农艺性状调查,筛选到20个穗长显著变短的株系和3个分蘖数显著增多的株系。3.在种子萌发期,定位到1个影响萌发率的耐盐QTL,位于3号染色体上,其贡献率为11.43%;在苗期,定位到2个影响盐胁迫下水稻幼苗存活率的QTL,分布在4和5号染色体上,贡献率分别高达28.90%和11.90%;在全生育期,定位到1个影响全生育期存活率的QTL,位于第7号染色体上,其贡献率为14.37%。定位到4个与穗长相关的QTL,分别位于第4、6、8和9号染色体上,贡献率分别为10.74%、8.85%、11.68%和16.20%;定位到1个与分蘖数有关的QTL,位于第6号染色体上,其贡献率为16.16%。4.开发了耐盐基因SKC1和DST连锁的分子标记并对代换系进行了基因型鉴定。根据代换系萌发期和苗期耐盐性表型鉴定结果和基因型结果推测SKC1和DST并不是海稻86耐盐的主效QTL;此外,利用已报道的调控穗长基因DEP1和Os GRF4分子标记对NIP和HD86进行检测,发现在NIP和HD86中扩增结果没有差异,均为无功能条带,推测HD86穗长可能存在其他基因调控。