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全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)已经鉴定出多个与帕金森病(Parkinson’s disease,PD)相关的遗传变异。然而,通过遗传变异影响PD的风险基因及功能性DNA元件仍然是未知的。本研究通过整合GWAS、表达数量性状基因座(expression quantitative trait locus,e QTL)和甲基化定量性状基因座等组学数据,鉴别了PD的风险基因并解析了其潜在的致病机制。首先,本文基于元分析方法汇总了两组GWAS数据,共得到超过600万个单核苷酸多态性位点,其中1,678个与PD显著相关(BHadjusted p-value<7.83e-09)。这些显著位点的富集分析涉及了轴突、神经元至神经元突触以及GABA能突触等与PD相关的通路,表明经过元分析的GWAS数据能够反映PD的病理特征。其次,采用基于汇总数据的孟德尔随机化和异质性检验方法,结合元分析的GWAS数据和e QTL数据鉴别了PD的风险基因。本研究发现了四个PD的风险基因在元分析GWAS结果中具有显著的效应:CRHR1、KANSL1、NSF和LRRC37A;同时也发现了两个新的风险基因STX4和BST1。其中最显著的CRHR1是已批准药物氢化可的松的靶标,因此氢化可的松有可能成为治疗PD的潜在药物。最后,本研究结合多组学数据解析了PD风险基因的潜在致病机制。通过筛选并注释与表达探针相关的51,940个DNA甲基化位点,明确了DNA甲基化在转录过程中发挥的调控作用,进一步探讨了两个基因的潜在致病机制:(1)当CRHR1启动子处DNA甲基化水平较低时,阻遏物与启动子结合,抑制CRHR1的转录,从而增加了PD风险;(2)当LRRC37A4启动子区域DNA甲基化水平较低时,转录因子和启动子结合,促进LRRC37A4的表达,从而增加了PD风险。本研究基于多组学数据分析,鉴定了PD的风险基因并解析了其潜在的致病机制,这对PD的诊断和治疗具有重要的意义。