DNA基分子导线构筑基元的设计及相关性质理论研究

来源 :山东大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Wayne_poplar
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
关于天然DNA导电性的诸多研究给出了相互不同甚至是相互矛盾的结果:在不同的实验测定中,DNA可以是绝缘体,半导体,导体甚至是超导体。实验证明,天然DNA的导电性强烈地依赖于序列、周围水环境、与电极连接方式等内在和外界条件,这也说明,天然DNA作为纳米分子导线的应用跟实际还有很大的距离。于是,近年来很多研究集中与DNA的修饰和性质改进工作,比如用人为设计的类似物替代DNA内部的嘌呤和嘧啶碱基(电荷是通过碱基间的堆积作用进行迁移的)。其中,扩环碱基和金属介导碱基对是其中比较突出的两种修饰方法。建立在前人工作的基础上,围绕DNA修饰和性质改进,我们开展了一系列有意义的工作,取得了一些有价值的研究成果。主要成果和创新简述如下: (1)多Cu介导碱基对G3cuC和A2cuT的理论设计和性质研究:相关研究工作表明,经过合适的金属修饰,DNA能够从绝缘体转变为半导体甚至是导体,这为设计DNA基分子导线打开了一个视角。后续关于Metal-base和Metal-DNA的研究也如火如荼地展开。已有研究都是关于单个金属修饰碱基对的,得到了很让人受鼓舞的结果。在前人工作的基础上,我们设想:如果采用多个金属修饰碱基对,是否应该取得更强的修饰效果呢?于是,我们设计了两个多Cu修饰碱基对G3cuC和A2cuT,并对其结构和电子性质进行了详细的研究和深入的讨论。结构上,G3cuC和A2cuT具有与天然Watson-Crick碱基对GC和AT相似的几何结构,而且尺寸有所扩大,大约1.0A,这为构建稳定的DNA双螺旋结构提供了良好的结构基础。更为重要的是,它们的HOMO-LUMO能隙和电离势都降低了,提高了空穴产生和迁移能力;同时它们中的电子横向传导能力得到了增强,这很可能会增强电荷在DNA中的纵向传导。这些都使得它们成为具有良好导电性的DNA基纳米线的优秀构筑基元。有趣的是,在许多方面G3cuC和A2cuT的关系类似于天然碱基对GC和AT之间的关系,这为定向设计DNA基分子导线提供了一定的信息。G3cuC具有所有闭壳层金属修饰碱基对中最小的HOMO-LUMO能隙。可以预见,Cum-DNA的导电性应该比天然相同序列的DNA有很大的改进。可以说,我们的研究为以后金属修饰碱基对和M-DNA的研究工作打开了一个新的视角。 (2)鸟嘌呤G和腺嘌呤A的外扩环修饰。人为设计碱基的其中一类是环扩大碱基,是通过一个芳香环和天然的嘌呤或嘧啶碱基融合而成的,比如x-base, y-base, yy-base和其他杂环扩展碱基等。相关的研究表明,这些扩环碱基都能选择性地与其他碱基配对并能够形成稳定的双螺旋DNA结构。更为重要的是,由于具有扩大的共轭区域,它们的HOMO-LUMO能隙、电离势相对于天然的碱基减小了,这将大大提高修饰DNA的空穴产生能力和迁移能力,有利于设计DNA基分子导线。但是,应该指出的是,相对于天然的碱基,这些扩展碱基的尺寸都有所扩大。因此,当它们部分取代天然碱基时,戊糖-磷酸骨架结构就会发生一定程度的扭曲,破坏DNA的稳定双螺旋结构。这对设计DNA碱基替代物提出了更高的要求——尽可能地改善它们电子性质同时还要保持它们的天然尺寸。巧合的是,Saito等人设计了一个空穴传导能力很高的DNA导线——将其中的腺嘌呤A替换为其衍生物——一个芳香环在N7-C8的位置并到A的芳香体系中。研究显示,这些衍生物的HOMO-LUMO能隙和电离势均低于天然腺嘌呤。它启发我们重新考虑是否有一种新的方法来提高DNA碱基的电子性能,同时保持它们的天然尺寸。我们认为,将一个芳香环由外部并入碱基体系就是一个很好的方法。在此,我们设计了一些鸟嘌呤G和腺嘌呤A的碱基衍生物——在N7-C8的位置融合/拼入一个芳香环,得到了benzodeazapurine (BDG和BDA),H2b-methoxy-substituted-benzodeazapurine (MDG和MDA)和C2b-N-substituted-benzodeazapurine(PDG和PDA);然后采用理论方法对它们的结构和电子性质进行了深入的研究和详细的讨论。跟事先预测的一样,所有的*G和*A(代表G和A的类似物)都是天然的嘌呤尺寸,为它们更随意地插入DNA改进其电子性质提供了很好的结构基础。由于母体结构没变,所以它们H键区域的静电势跟天然G和A是一样的,因此它们应该对C和T具有很强的碱基配对选择性。就电子性能而言,*G和*A及其碱基对的HOMO-LUMO能隙和电离势都有很大程度的减小——也就是说,由此构建的DNA的能带间隙将小于同序列的天然DNA,即更好的导电性,而且产生空穴和空穴的传导能力也更好。就三种不同的修饰方法而言,最好的是MDG和MDA,其次是BDG和BDA,PDG和PDA稍差。一般认为空穴是通过碱基对的HOMO在DNA内纵向传导,因此如要涉及不受序列影响的DNA导线,MDA是最好的选择。而PDA就不能采用因为它甚至会阻止空穴的传递。与xG, yG, xA和yA比较可知,外部并入苯环是可行的,改善电子性能的同时还保持了天然的碱基尺寸;而且在外部裸露的H和C原子位置还可以做进一步的修饰,比如MDG和MDA,在BDG和BDA的基础上电子性质更有所改进。
其他文献
<正>美国纽约罗斯威尔帕克癌症中心的科研人员在新近出版的《癌症起因与控制杂志》上发表了一项研究报告显示,癌症患者在诊断前后坚持有规律的运动,能显著提高其生存率。研究人员对5 800名早期至晚期的癌症患者进行了研究。结果发现,在癌症确诊前后每周运动3~4次的受试者,其死亡风险比不运动的要低49%。即使在癌症确诊后才开始运动的人,其存活率也与确诊癌症后不运动的
期刊
本文我们研究广义Jabotinsky泛函微分方程G(z)·F’(z)=G[F(z)]+H[z,F(z),…,Fm(z)]在原点的邻域内解析解的存在性问题.我们在Brjuno条件下给出了解析解的结果,利用戴维引理讨论一个辅助方程(2.0.2)在不同条件下的幂级数解的存在性问题,从而进一步推出原方程的解析解的存在性问题. 全文的结构安排如下: 在第一章中我们主要介绍了小除数理论、迭代函数方
学位
Feynman-Kac公式解决了二阶线抛物型和椭圆型偏微分方程的显式解问题。为了推广Feynman-Kac公式,得到次线性偏微分方程的解,Pardoux和彭在[1]中建立并研究了一类新的随机方程:倒向随机微分方程(BDSDEs)。伴随着Feynman-Kac公式的扩展形式(给出了二阶线抛物型和椭圆型随机偏微分方程的显示解),Pardoux和彭继而在[4]中引入了一类新的方程:倒向重随机微分方程(B
学位
本论文主要介绍了在G框架下G-布朗运动的不变性原理,这里的G框架建立在不确定的环境中。进一步,我们介绍了一个关于不变性原理在金融中应用的小猜想。自从Artzner, Ph.,F.Delbaen, J.-M.Eber和D.Heath的学术著作[12],[13]发表以来,关于一致风险度量和次线性期望的研究取得了丰硕的成果。介于对Rosazza,G.E. [16]文章的参考,我们尝试寻找G-期望和条件G
学位
时间序列分析的许多基本结果建立在其多个样本自协方差函数联合服从渐近正态分布的基础上。本文针对线性平稳序列的若干个样本自协方差函数,讨论其联合渐近分布问题。众所周知,在个数事先固定后,样本自协方差函数的联合渐近正态是一个著名的结果,是时间序列拟合优度检验,比如独立同分布白噪声检验,的一个基本理论依据。然而在实际应用中,我们经常是先得知样本的容量n,然后选取某个m,把m看成是固定,之后引用上面的经典结
学位
<正>茶艺课程是中职旅游管理专业中的一门重要课程。通过让学生有的放矢、卓有成效地学习茶艺课程,不仅可以提升学生的茶艺素养,还可以丰富学生的旅游管理知识。当前,中职茶艺课程主要面临研习茶艺理论与开展茶艺实践之间缺乏衔接、枯燥茶艺知识与趣味茶艺文化之间缺乏融合、虚拟茶艺环境与趣味茶艺文化之间存在差异等现实困境。围绕这些现实困境,教师可以采取“有效衔接茶艺理论与茶艺实践、深度融合茶艺知识与茶艺文化,以及
期刊
期刊
随着国内各地区建设工作的蓬勃发展,我国的国土空间规划的方式以及体系也得到了不断的完善与创新。在我国的国土空间规划体系中,城市规划工作起到了极为重要的作用。只有切实把握国土空间规划体系与城市规划之间的关系,才能使城市得到更为合理规划方案,以此确保我国社会的稳定发展。本文将依据相关工作经验以及研究成果,从多个角度分别探析国土空间规划体系中的城市规划工作,并对此提出相关的策略以及一定的建议。最终希望通过
期刊
随着我国城市化进程的不断深化,城市规划逐渐成为城市开发建设的蓝图,也是完善城镇各功能组团的有效依据。但现阶段城市规划仍受各种因素影响,存在较多的问题,因此在我国建立国土空间规划体系并监督实施的大背景下,需对传统城市规划作出相应的调整和改变。基于此,本文对在国土空间规划体系下传统城市规划优化调整的必要性和国土空间体系下城市规划的传承与融合的具体措施进行了深入的探讨。
期刊
当前,城市规划面临经济发展与环境保护的双重挑战,如何更好地贯彻高质量发展要求,为人民群众提供更多的优质产品,是当前城市规划需要考虑的重要问题。国家国土空间规划体系涉及城市规划的方方面面,需要各个部门、各行各业按照新形势、新任务和新要求加强协作,创造新局面。基于此,文章对我国城市国土空间规划的具体情况进行深入探究,提出相关的改进举措,以进一步保障国土空间规划体系的规范运作及城市建设的高质量发展。
期刊