本研究利用cDNA-AFLP方法分离了6个草菇菌丝低温诱导表达基因：VA、VC、VD、VE、VF、VH。DNA序列测定结果表明，VA为359bp，VC为2246p，VD为360bp，VE为173bp，VF为550bp（未测完全长），VH为176bp。BLASTn搜索结果表明，VD与Serpula himantioides的28S rDNA高度同源，其同源性达96％，其它序列VA、VC、、VE、VF、VH在GenBank中未找到与之同源的基因。BLASTx搜索结果表明，VA部分序列编码的蛋白和Aspergillus fumigatus中的α-1，3-葡聚糖合成酶同源性达55％，VD片段的27bp-359bp之间的序列编码蛋白和Pisum sativum中的衰老相关蛋白同源性达59％，片段36bp-179bp之间序列编码的蛋白和Branchiostoma californiense的前蛋白转换酶aPC6C同工酶的同源性达68％；VE和Danio rerio中的糖原合成激酶3-α同源性达62％，与Arabidopsis thaliana中的丝氨酸／苏氨酸蛋白质激酶同源性达58％；片段VF序列399bp-548bp之间编码的蛋白和Erwinia amylovora中的一种推测蛋白同源性达100％，与质粒ColE1的ORF同源性达88％；片段VC、VH未找到与之同源的蛋白质序列。 以草菇基因组DNA为模板，设计了两对引物gpdR₁、gpdF₁，利用PCR技术克隆了草菇的一段启动子片段。DNA序列测定结果表明，该片段长1367bp，DNA序列比对结果显示，在GenBank中不存在与之同源性较高的序列。采用Promoter Scan和PlantCARE软件对克隆的草菇启动子片段进行分析，结果表明此序列的正负链各有一启动子区，含有TATA-box，CAAT-box，G-box，GC-motif，Spl-box，CT rich-motif等顺式作用元件。采用Tfsitescan service软件分析克隆的草菇启动子片段，结果表明，该片段含有多个转录因子如GCR1，GCN4，AFT1，nit2，GF1等的结合位点。