高等教育课程结构问题一直是关系着高等教育发展的重要问题,它与教育的目的、形式、方法以及结果都息息相关。对高等教育本科课程结构问题进行研究,既有深刻的理论意义,又有切实的实践意义。本文通过对国内外课程结构演进历程的梳理,探寻不同历史时期高等教育课程结构的特点,并以国外知名高校为案例,对其课程结构进行分析研究；同时选取国内13所代表高校的六个常见专业作为研究对象,从人文、社会、科学课程三分法的视角,分别探究了整体课程、公共基础类课程、大类基础课程、专业课程的课程结构及其之间的关系。通过研究发现了国内外的课程结构演进均经历了人文课程占主导,到科学课程崛起人文课程衰弱,再到人文科学课程协调发展的过程。对我国代表高校当前课程结构的研究发现了学校层次与学校提供的人文、社会、科学三类课程在数量及比重上的关系：数量上,总体看来985工程院校人文、社会、科学课程的数量最多,211工程院校次之,一般地方性院校数量较少；比重上,总体看来人文课程比重985工程院校最高,一般地方性院校次之,211工程院校人文课程比重最低；社会课程的比重在三类院校中相差不大；科学课程的比重在211工程院校中最高,在一般地方性院校中次之,在985工程院校中最低。针对被研究的13所院校在课程结构上呈现出的上述特征,结合国内外课程结构演进历程,文章进一步从历史、教育价值观、现实及素质教育的视角进行深入探讨。发现了课程结构的发展变化与社会的政治、经济及生产力等因素密切相关；课程结构也反映出个人本位教育价值观和社会本位教育价值观对高等教育课程的影响；素质教育是在我国教育实情下应运而生的,它较好地平衡了教育的价值理性和工具理性,并提出一些关于我国高等教育课程结构的思考及认识。