Hypb基因敲除小鼠胚胎干细胞的转录组研究

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Hypb是我们实验室从 CD34+造血干/祖细胞 cDNA文库中克隆到的一个含有SET结构域的基因。我们实验室先前的工作已经证实它的 SET结构域具有组蛋白H3K36特异性甲基转移酶活性并可以催化自身甲基化,它还含有一个新的转录激活结构域,能与磷酸化的RNA聚合酶II发生特异的相互作用。随后,通过基因敲除小鼠模型的建立及表型分析,Hypb又被证明是小鼠胚胎和卵黄囊血管发育必需的基因,且特异性催化 H3K36me3。为了进一步明确 Hypb基因的生物学功能,我们建立了Hypb基因敲除的小鼠胚胎干细胞,以此为模型,研究Hypb对ES细胞自我更新和定向分化功能的影响。我们的实验结果提示Hypb的缺如对ES细胞自我更新无显著影响,严重干扰了ES细胞的内胚层定向分化。同时从转录组学层次上,我们发现HYPB不仅调节内胚层相关基因表达,同时可以调节多个EMT相关基因表达,这提示HYPB可能通过EMT调控ES定向内胚层的分化。除此之外细胞骨架相关基因、wnt信号途径相关基因的表达在Hypb+/+和Hypb-/-ES细胞之间均存在不同程度的差异。
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