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本文进行了如下研究:
一、节旋藻exDNA的种质差异性研究
在完善已有节旋藻exDNA提取技术方法的基础上,考察了7株钝顶节旋藻的exDNA。结果表明,被检测的藻株中均含有exDNA,且不同藻株exDNA的种类与大小不尽相同。结合基于16S rRNA基因序列及cpcHID操纵子序列对7株钝顶节旋藻所作的分子系统学研究结果首次表明,节旋藻exDNA的种类和大小与种质间差异性密切相关,即亲缘关系相近的品系间exDNA也较相近,反之亦然。
二、节旋藻exDNA的克隆及序列分析
采用直接末端补平克隆、酶切后克隆以及超声波处理后克隆三种策略对Sp-3藻株中的两种exDNA (exDNA-L和exDNA-S )进行了克隆。利用生物信息学方法对克隆并拼接成的5个exDNA片段(exDNA-L1 , exDNA-L2, exDNA-L3,exDNA-S1, exDNA-S2)作了结构和功能分析。结果表明:(1) exDNA-L1为2589bp,含有两个ORF,分别推测编码双组分信号转导系统的组氨酸激酶和反应调节蛋白;(2) exDNA-L2为1216 bp,含有一个OKF,推测编码的蛋白包含Chew和CheY结构域,这两个结构域是细菌趋化性双组分信号转导所必需的;(3)exDNA-Sl为936 bp,含有一个ORF,推测编码组氨酸激酶的PAS/PAC感受器;(4) exDNA-L3为900 bp,存在较多的正向重复和反向重复序列,且在5端存在一个不完整的推测编码转座酶的ORF; (5)虽然exDNA-S2中也存在一个ORF,但该ORF不存在己知功能的结构域。
虽然本文尚未获得exDNA-L和exDNA-S的全长序列,但从己知的几个ex-DNA片段的结构和功能分析结果来看,exDNA-L和exDNA-S中存在编码双组分信号转导系统的相关基因,且这些基因很可能参与节旋藻多种适应性调节,如光和氧的调节,趋化性调节等。
三、exDNA-S1-ORF的表达及其产物纯化
将己克隆的exDNA-S1片段上的ORF亚克隆至pET-30a(+)表达载体,然后将重组载体导入大肠杆菌BL21中表达。经聚丙烯酞胺凝胶电泳鉴定,目的ORF得到了高效表达,但表达产物主要以包涵体的形式存在。利用6 mo1/L的盐酸胍溶液将包涵体溶解,然后通过Ni-NTA亲和层析、梯度透析,最后得到了电泳纯的目的蛋白,为进一步研究节旋藻exDNA的生物学功能奠定基础。
四、exDNA-S1-ORF表达产物的抗体制备及免疫学分析
以表达并纯化的蛋白为抗原免疫新西兰纯种兔4次,制备多抗血清。经间接ELISA法测定,获得的多抗血清效价达到1: 204,800。进一步地利用多抗血清对钝顶节旋藻SP-3全细胞可溶性蛋白所作的Western blot分析结果表明,exDNA-S的ORF在藻株Sp-3中能进行表达,,这说明exDNA并非节旋藻中的冗余DNA序列,而是具有特定的遗传功能。