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背景:多发性硬化(MS)是一种自身免疫介导的以中枢神经系统炎性脱髓鞘病变为主要特点的疾病。目前病因及发病机制尚不十分清楚,临床无法治愈。许多研究证实适应性免疫在该病的发病机理上有着关键的作用,且主要由T细胞介导。研究多发性硬化患者外周血T细胞中差异表达基因及信号通路,可以为寻找和证实多发性硬化致病机理提供了理论依据。目的:找到多发性硬化患者外周血T细胞中发生差异变化的致病相关基因及关键通路。方法:首先,我们从GEO数据库下载了多发性硬化转录组基因表达谱数据系列GSE43591,GSE13732,GSE32988,共包含了42个患者T细胞试验样本和35个健康对照样本的基因芯片数据;以及miRNA表达谱数据系列GSE43590,包括6例多发性硬化患者和6例对照组的外周血T细胞样本。其次,我们在R软件中使用limma包等筛选鉴定出差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并进行了层次聚类分析及主成分分析。再次,将三个转录组基因表达谱数据系列中每两个数据系列的表达上调DEGs组和表达下调DEGs组的DEGs进行交集,得到了77个上调DEGs和61个下调DEGs用于进一步分析,然后采用包括DAVID、PATHER、Reactome、STRING及Cytoscape里的ReactomeFIPlugIn和Cytohubba应用程序等多种方法进行基因功能和通路富集分析、PPI网络分析和关键基因分析。最后,我们还利用starBase数据库及miRDB数据库预测了miRNA-mRNA靶向关系。结果:我们确定了最重要的关键DEGs,包括EIF4E、RPL37A、RPS24、RPL31、EIF4G1、HIST2H2BE、CCL5、NACA、SMC3、SRSF11、TPR、ZEB1、CCR2、HNRNPA0、OTUD1、PURA;较为关键的miR有:miR-494-3p、miR-106b-5p、miR-15b-5p、miR-23b-3p、miR-29a-3p、miR-30b-5p、miR-30c-5p、miR-30d-5p、miR-320d、miR-425-5p;以及通过miRNA-mRNA靶向关系分析筛选出的前20位的关键差异表达基因为:CDK6,AMMECR1,ETNK1,SPTBN1,USP46,RICTOR,ITPKB,TNFAIP3,DMXL1,EEA1,NRIP1,IRS2,UBE2V2,C10orf76,ANKRD12,SACS,ARRDC3,HNRNPA0,EIF4E,SOCS3。而且,发现了一些涉及多发性硬化患者致病相关的通路如:白细胞介素-10信号、趋化因子和细胞因子信号通路介导的炎症、脂肪细胞因子信号通路、瘦蛋白信号、趋化因子信号通路;以及生物过程如:单核细胞趋化作用、中性粒细胞趋化作用、自然杀伤细胞趋化作用的正调节、趋化因子介导的信号通路、病毒转录、T细胞趋化作用的正调节;和分子功能如:RNA结合、CCR1趋化因子受体结合、蛋白结合、CCR5趋化因子受体结合、多聚(A)RNA结合、热休克蛋白结合等。结论:这些关键致病基因及微小RNA可能通过多种信号途径引起多发性硬化,并参与其发病过程。这些发现为选择与多发性硬化的诊断、治疗和预后有关的靶标提供了新的视角。