生态补偿问题一直以来都是党和政府工作的重点,尤其在国家“十二五”规划中提出生态文明建设理念后,把中国生态文明建设推到一个全新战略高度。生态补偿额测度是生态补偿机制完善的关键,如何科学合理测度补偿额,特别是涉及水资源安全这一关系人类生命健康福祉及经济社会可持续发展的流域治理的流域生态补偿额测度显得尤其重要。国内外关于生态补偿研究由来已久,流域生态补偿额测度方法近年来成为研究重点,且已提出了不同的测度方法,但各种方法均存在不同程度的不足,且未形成统一的测度方法与体系。通过对国内外流域生态补偿额测度方法进行梳理与总结,进而在弥补各种方法不足的基础上,结合全面性、动态性和力求量化的原则,提出基于流域上下游产业间的“成本-效益”分析机理及分类测算方法。以新安江流域生态补偿额度测算为研究对象做实证研究,使用机会成本法、生态服务价值法、条件价值评估法、水资源价值法、总成本修正法、综合比较法与“成本-效益”分类核算法等方法分别测算新安江流域生态补偿额。归纳总结各个方法在实践测度时存在的问题并提出改良策略,以期使之形成更加完善的流域生态补偿额测度方法体系。通过实证研究发现,基于不同视角的测算方法得到的补偿额度存在差异,如何在测算理论、方法与技术等层面进行可行性研究是目前摆在流域生态补偿及相关补偿面前的核心问题。