中小板上市公司在其控股股东性质、两权分离程度、股权集中度和市场化程度等企业治理特征等方面与主板上市公司有所不同。根据中小板公司治理与绩效关系的特征和现有研究的缺陷,本文采用反映中小板公司综合绩效的指标和偏相关分析方法,比较了不同所有权性质的企业,其股权集中度、流通股比例、“两职”状态、独立董事比例、董事会规模、高管持股比例等企业治理特征对其绩效影响的差异。研究发现,中小板市场国家控股企业和非国家控股企业治理特征不同：国家控股企业第一大股东持股比例高于非国家控股企业,且显著高于其他大股东的持股比例,第一大股东绝对控股,即国家控股企业其他大股东对第一大股东的制衡作用与非国家控股企业相比较小；中小板市场国家控股企业董事长和总经理兼任的企业远远小于非国家控股企业两职兼任的企业；国家控股企业高管的股权比例较低,非国家控股企业高管的股权比例较高。中小板市场国家控股企业和非国家控股企业治理结构对绩效的影响不同：国家控股企业应防止“一股独大”,非国家控股企业不妨“一股独大”；国家控股企业流通股与绩效不相关,非国家控股企业流通股与绩效正相关；国家控股企业的应采用两职兼任,非国家控股企业反之；国家控股企业独立董事发挥出其作用,非国家控股企业独立董事是“花瓶”;国家控股企业过大的董事会规模减低了企业绩效,非国家控股企业董事会规模与绩效无关；国家控股企业高管的股权激励给绩效带来正影响,非国家控股企业给绩效带来负影响。根据实证结论,得出对策建议对于国家控股企业应优化股权结构,鼓励机构投资人或社会公众持股,减少国家股权,让更多的私有产权主体参与企业的运营管理,以增强国家控股企业绩效的提高。同时应加强中小板市场国家控股企业其他大股东的比例,增强控制权市场的竞争程度,以增强对第一大股东的制衡作用。增加流通股的比例,增强流通股东对公司的约束力,以给绩效带来积极影响；应增强董事会的独立性,降低董事会规模。为增加国家控股企业董事会的独立性应采用董事长和总经理两职分任的制度安排。两职的分离有利于加强董事会对经理层行为的监督,从而促使企业经营活动的持续健康发展,这也起到了降低代理成本的作用。国家控股企业过大的董事会规模影响了董事会成员间的沟通与协调,进而影响了企业的绩效,因此应减低董事会的规模；同时应强化股权激励。对于非国家控股企业：应强化董事会的职能和权力,确立董事会的权力地位,明确董事会的决策控制职能和权力制衡作用的发挥,避免董事会的沦为“摆设”。另外要提高独立董事参与公司治理的积极性,促进独立董事对公司事务的参与,以增强其作用的发挥。在现阶段为为增加非国家控股企业在企业发展过程中的灵活性和创新性应采用董事长与总经理两职兼任的制度安排；同时,应改进管理层的激励结构和选聘机制。应适当减少非国家控股企业的管理层持股,引起先进的管理人才加入到企业的管理团队,为企业的长远发展奠定基础。