应用酵母双杂交技术筛选直藻MBP相互作用蛋白

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目的:自从MAR(Matrix Attachment Region)片段分离以来,有关MAR及其功能的研究一直是分子生物学的热点之一。目前已知MAR具有提高转基因表达水平等作用,但MAR的作用机制尚不清楚。MAR作为顺式作用元件,其作用是和其结合蛋白有关的。但目前对MAR结合蛋白的研究较少,只有少部分MAR结合蛋白被分离出来。前期研究中,已从真核单细胞杜氏盐藻中筛选出一个MAR结合蛋白(MAR-binding protein,MBP),该蛋白基因全长1623bp,原核表达及其功能研究证实该蛋白能与MAR结合,蛋白定位于细胞核。本研究中,拟通过构建“诱饵”载体pGBKT-MBP,进而利用酵母双杂交从杜氏盐藻cDNA文库筛选与MBP相互作用的蛋白,探讨MBP基因的性质及生物学意义。   方法:提取杜氏盐藻总RNA,根据GenBank数据库MBP基因序列,设计引物,RT-PCR扩增MBP基因全长。将扩增的MBP基因依次插入pMD18-T及pGBKT-7载体,构建酵母双杂交诱饵载体。将经过酶切、测序鉴定正确的pGBKT-MBP载体转化酵母菌株Y187,检测诱饵载体毒性及自激活。将通过检测的Y187菌株(转化有“诱饵”质粒)与AH109菌株(含有文库质粒)进行杂交融合,在缺陷性平板筛选克隆,并通过MEL1基因显色反应来鉴别阳性克隆。提取酵母阳性克隆文库质粒,与诱饵质粒进行一对一回复性杂交,再次确认阳性克隆,并对克隆进行生物信息学分析。   结果:利用RT-PCR技术成功扩增出1623bp片段,将该片段插入pMD18-T及pGBKT-7载体,经酶切、测序分析该片段为MBP基因全长。pGBKT-MBP载体转化酵母菌株Y187,仅在SD/-Trp平板生长,且为白色菌落,而在SD/-Trp/-His、SD/-Trp/-Ade平板均不生长,表明“诱饵”质粒无自激活。单菌落过夜摇菌后OD600值大于0.8,表明“诱饵”质粒对酵母菌株无毒性。经过筛选杜氏盐藻cDNA文库,初步筛选出26个克隆,经过多次X-α-Gal平板筛选,最终确定7个阳性克隆。   结论:成功运用酵母双杂交技术从杜氏盐藻cDNA文库筛选MBP相互作用蛋白。筛选出了光合反应中心亚单位等7种可能与MBP相互作用的蛋白,但还需要进一步验证。
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