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本研究利用cDNA-AFLP改良法分离了13个草菇菌丝低温诱导表达基因v1，v2，v3，v4，v5，v6，v7，v8，v9，v10，v11，v12，v13。DNA序列测定结果表明，V1为488bp，V2为551bp，V3为557bp，V4为285bp，V5为173bp，V6为604bp，V7为743bp，V8为836bp，V9为709bp，V10大约为720bp（未测完），V11和V12是同一基因片段为1077bp，V13为617bp。BLASTn搜索结果表明V1，V2，V3，V4，V5，V6，V7，V9，V10，V11，V12，V13为未知新基因，V8与ATP酶同源率较高，在一段长312bp的区域，与ATP酶的同源率达84-93％。BLASTx搜索结果表明：V1，V2，V3，V4，V6，V8，V11（V12），V13的mRNA翻译产物能够找到同源率较高的蛋白，其中六个基因片段，V1，V2，V3，V4，V8，V11的mRNA翻译产物与其他真菌蛋白的同源率较高。V3的mRNA翻译产物与灰盖鬼伞细胞色素P450的同源率为33％，V8的mRNA翻译产物与粗糙脉胞菌的ca2+-ATP酶同源性为68％。 本研究以草菇基因组DNA为模板，设计了一对引物（rasR1，rasF1），利用PCR技术克隆了草菇的一段启动子片段r5a。DNA序列测定结果及DNA序列对比结果显示：该启动子序列（r5a）与已知的食用菌ras启动子同源率低，采用Plant Prediction和Plant Care软件对克隆的草菇启动子片段进行分析，结果表明该启动子序列的243-293bp及539-589bp区域为预测的基础启动子区，有两个转录起始位点（283bp及579bp处），有多种重要的顺式作用元件，如TATA-box，CAAT-box，G-box，ABRE元件，WUN-motif，HSE元件，P-box，TATC-Vbox，I-box等。