随着贝类养殖规模的逐年扩大,要想提高养殖效益,对贝类自身调节机制的研究必不可少。在贝类养殖生态系统中,贝类的下行控制作用是非常关键的环节,贝类摄食完成了物质和能量由生产者向更高营养级的传递。通过对贝类下行控制作用的研究,可以为贝类养殖活动提供更多的参考。本文在对贝类滤水能力相关研究的基础上,设计围隔实验,以菲律宾蛤仔和长牡蛎作为研究载体,通过测定在不同养殖密度下,培养围隔水体中营养盐循环、浮游植物群落结构、微型浮游生物以及水体环境因子的时间变化,以此揭示了养殖贝类下行控制作用的相关机制;同时借助一些对营养盐施肥的相关研究,以稻壳灰作为硅酸盐肥料,探究施加硅肥对贝类养殖的影响;另外针对一些学者提出的贝类作为“生物滤器”的观点,进一步做了围隔实验验证,探究贝类养殖用来去氮和缓解富营养化的可行性。主要结果如下:养殖贝类对水体中营养盐的下行调控主要体现在氮盐的累积和硅酸盐的消耗上。贝类摄食水体中浮游植物以及形成生物沉积物,加强硅从水体中的流失,在有菲律宾蛤仔或牡蛎养殖的围隔内,其水体中硅酸盐含量减少量是对照组的两倍还多;同时通过呼吸代谢作用,增加氨氮的释放,造成养殖水体中氮富余和硅缺乏,营养盐结构的改变,增加了养殖水体出现硅酸盐限制的风险。通过施加硅肥,有效向水体中补充硅酸盐,缓解硅限制的发生。养殖贝类的下行控制作用,主要是通过贝类的摄食实现的。贝类摄食水体中浮游植物和颗粒有机物质,明显降低水体中浮游植物丰度,养殖密度差异是主要的影响因素,高密度养殖显著清除水体中浮游植物生物量,十天内可以清除浮游植物总生物量的70%,叶绿素水平的变化与之相一致。其次,贝类对浮游植物的下行控制作用还体现在群落结构的改变上,牡蛎选择性摄食,浮游植物群落结构表现为由甲藻优势向硅藻优势转变的趋势,特别是在高牡蛎密度养殖组,实验结束时甲藻被消耗殆尽,硅藻大量增殖,生物量增长了近万倍。再次,对浮游植物种群优势度分析的结果显示,养殖水体中的优势种由原先的纤细原甲藻（Prorocentrum gracile）,在实验中期变成扁压原甲藻（Prorocentrum compressum）,到了实验后期新月柱鞘藻（Cylindrotheca closterium）成指数式增殖,成为了新的优势种,浮游植物粒径的变化出现了小型化的趋势。同时,稻壳灰肥料的添加,促进了这种进程的发生。我们分析了贝类养殖过程中,对水体溶解氧和p H的影响,贝类呼吸代谢消耗水中溶解氧,降低DO和p H水平,并使水体呈弱酸化;稻壳灰施肥有效改善养殖环境。由于贝类的选择性摄食,对于粒径较小的物质难以滤食,贝类摄食作用对微型浮游生物群落的影响较小,但微型浮游生物对营养盐的变化较敏感,贝类下行控制作用通过调节营养盐循环,间接影响nano级浮游生物和异养细菌的增殖。我们的研究结果支持贝类作为“生物滤器”的观点,即贝类养殖活动可以去除水体中多余的氮,缓解氮富营养化的发生。单纯的贝类养殖虽然可以做到对水体中氮的去除,但是效果甚微,同时,在高密度养殖下,去除的氮并不能被贝类所利用,大部分都转移到了沉积物中。稻壳灰施肥可以增强氮去除效果,提升贝类生长量,增加养殖效益。