诸城市三种毛皮动物源大肠杆菌流行病学调查及遗传相关性分析

来源 :山东农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gongwen_2003
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
大肠埃希氏菌能够引起动物和人的大肠杆菌病。它广泛存在于动物和人的肠道中,既属于肠道常驻菌,又是一种条件致病菌,一些特殊的血清型或者其他非传染性条件和传染性病原诱发动物和人感染此菌。为研究诸城地区的水貂、狐狸、貉子中大肠杆菌的流行病学情况以及分离菌株之间的遗传相关性,于2017年8月份从诸城地区三个距离较近的养殖场共采集粪便样品182份,其中水貂养殖场采集78份、狐狸养殖场采集97份、貉子养殖场采集7份。采集样品经处理后,进行增菌、选择性培养基培养和16SrRNA鉴定等方法对大肠杆菌进行分离鉴定。对分离菌株进行凝集实验,鉴定31种致病性血清型;采取纸片琼脂扩散法(K-B法)对分离菌株用14种常用抗生素的耐药情况进行检测;提取分离菌株DNA,检测24种耐药基因的存在情况以及I类整合子;对分离菌株进行Multilocus sequence typing(MLST)分型,分析其溯源和遗传进化关系。从而阐明大肠杆菌在该区域三个养殖场的流行传播情况。经分离鉴定,182份样品中的95份含有大肠杆菌,阳性率为52.20%(95/182)。经凝集实验鉴定,17株大肠杆菌属于可致病血清型,包括10种不同的类型,其中O104:H4测出率最多为23.53%(4/17);药敏实验的结果表明,95株分离的大肠杆菌对14种抗生素的耐药表现有差异,对氨苄西林的耐药性最高,为91.58%(87/95);对头孢西丁表现为敏感,耐药率分别为1.05%(1/95)。共检测出15种耐药基因,其中检出率最高的为喹诺酮类的耐药基因qnrS,检出率为66.32%(63/95),检测到31株大肠杆菌携带I类整合子,检出率32.63%,I类整合子检测结果发现,菌株中共携带7种耐药基因盒,最多的基因盒为dfrA27+aadA2+qnrA(17/31),携带整合子的分离株中多重耐药的菌株比率93.55%。SAS软件结果表明耐药基因的存在与大肠杆菌对该类抗生素耐药彼此之间的相关性差异很大(P<0.05),与某一特定的耐药基因存在有关,本实验中耐药基因sul1的携带与复方新诺明耐药之间呈正相关。对95个ST序列分析后,得到55个不同的ST型,其中ST46序列型表现为最多,占总数的11.57%(11/95),没有出现新的等位基因型;存在七个克隆群(CC1~CC7)最大的克隆群为CC6,由ST10与ST218、ST48、ST215、ST744、ST43、ST1634、ST656、ST716所组成,分离菌遗传进化关系比较近的不同菌株趋向于来自同一物种;其中ST189、ST10、ST46分别对应克隆群CC5、CC6、CC7的克隆祖代;致病性血清型在遗传进化树上呈离散分布,与菌株之间的遗传关系远近和ST型无相关性;在耐药谱组成上无关联;同一克隆群中大部分在进化分支上比较近,存在部分菌株相差较远如st4147和st189,形成这种情况的原因可能与不同菌株七个管家基因序列之间的差异度大小有关;进化分支较近的分离株与其耐药谱的携带存在一定的关联性。本研究完成了诸城地区三个毛皮动物源养殖场中的水貂、狐狸、貉子所携带的大肠杆菌流行特点、致病性血清型分布,以及对常用抗生素的耐药规律以及耐药基因、整合子的携带情况等的分析。诠释了该地区大肠杆菌的分布特点、耐药规律,以及流行特点和遗传进化关系,从而针对可能发生的毛皮动物源大肠杆菌病的爆发,制定出有效的预防对策。
其他文献
脂肪细胞可以蓄积甘油三酯(TG)以备能量的消耗。与哺乳动物相似,鱼类脂肪细胞内过度蓄脂也会引发一系列代谢疾病。内质网是营养素的敏感感受器,参与细胞内脂质的合成与转运。
随着化石燃料燃烧带来的能源短缺及污染问题日益突出,生物质作为世界第四大能源,以其产量巨大、分布广泛、碳循环等优点已引起全球的广泛关注。生物质气化及气化燃烧是解决生
土工织物作为一种反滤材料广泛应用于反滤、防水、隔离等工程实践中。土工织物进行反滤设计时,需要满足保土、透水、防淤堵三个原则,织物孔径是反滤设计的重要参数。工程应用
目的:本研究基于“肺与大肠相表里”理论,应用“提壶揭盖”法,予常克教授经验方“葶苈丸加味”治疗小儿便秘(痰热型),研究该方案的临床疗效、安全性及复发率,探讨其可行性、
在解析数论中,研究等分布理论,L-函数的零点分布等问题,自然会涉及到非线性指数函数的振荡问题.我们通常考虑一般的非线性指数和,其形如这里,n~X 表示 X ≤ n ≤ 2X,且e(z)=e2πiz.当β=1/2,Vinogradov[12]研究了关于von Mangoldt函数an=A(n)的非线性指数和S(X,α)的振荡问题.对于an=A(n)和an=p(n)(μ为莫比乌斯函数)的情形已经被Iw
随钻声波测井广泛应用于海上钻井作业。地层纵波测量中常使用单极子声源,但单极子声源会激发沿钻铤传播的钻铤模式波,对纵波的测量造成不利影响,为了消除钻铤模式波的影响,本
在日趋严格的环保法规及标准制约下,“废弃物资源化”与“废水达标排放”已成为炼化行业可持续发展的两大瓶颈。本研究以炼化行业剩余活性污泥(Excess Activated Sludge,EAS)
荧光分子断层成像是分子影像领域中的一种光学成像模态,其通过外置的光源照射生物体内的荧光团发光,然后用探测器测量体表的荧光强度,最后通过求解逆问题来重建荧光团在生物体内的三维分布。然而由于测量的荧光数据局限于体表,生物组织对光的散射和吸收作用以及测量噪声的存在,导致重建问题的病态性严重,重建的荧光团边缘比较模糊,目标识别较为困难。尽管设置较多的激发点可以测量更多的数据从而提高重建的质量,但其增加了数
天目铁木(Ostrya rehderiana)是中国东南部唯一的铁木属植物,目前仅存位于浙江临安西天目山保护区的5棵野生成年植株,是国家重点保护植物。5株植株中仅1株能够正常结种、种子
随着社会的发展,人们对林产品资源的需求量不断增加,我国南方大力发展以钩栗(Castanopsis tibetana Hance)为主要珍贵树种的速生、丰产用材林。以永龙界国有林场50a钩栗天然