我国棕榈蓟马遗传多样性与种群遗传结构研究

来源 :北京林业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:susanna2005
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棕榈蓟马Thrips palmi Karny,属缨翅目Thysanoptera蓟马科Thripidae,危害多种作物,是农林业生产上的重要害虫。棕榈蓟马起源于南亚地区,目前已扩散到日本、韩国、澳大利亚等国家以及我国大部分地区。种群遗传变异可能会导致棕榈蓟马对新环境的快速适应和爆发危害。明确不同种群的多样性和遗传结构,对明确棕榈蓟马快速传播扩散的机制、制定防控措施等具有重要的理论和实践意义。本研究在开发棕榈蓟马微卫星标记的基础上,研究我国不同地理种群和不同寄主上棕榈蓟马遗传多样性和种群遗传结构,探讨地理、环境、寄主植物和化学防治措施等因素对该虫种群遗传变异的影响。主要研究结果如下:(1)棕榈蓟马微卫星标记开发利用高通量测序技术测定了 356 MB的棕榈蓟马基因组草图,搜索得到104229个位点适于引物设计,其中64.02%为二核苷酸重复序列位点。筛选了 60个位点在7个个体进行验证分析,根据扩增效率和多态性开发得到了 26个多态性微卫星标记,为棕榈蓟马遗传遗传多样性和遗传结构研究提供分子标记。(2)不同地理种群棕榈蓟马遗传多样性利用微卫星标记和线粒体COⅠ基因序列对我国14个地理种群、日本1个地理种群的棕榈蓟马进行了研究。不同地理种群中等位基因数为3~32,观测杂合度的范围分布于0.2803~0.6491,近交系数在-0.0769~0.1840之间,等位基因丰富度为1.91~6.48,私有等位基因丰富度为0.09~0.97。我国南方种群的遗传多样性明显高于北方种群。(3)不同地理种群棕榈蓟马的遗传结构对不同地理种群棕榈蓟马的遗传结构进行分析,发现15个地理种群的棕榈蓟马存在明显的遗传分化,种群间分化指数为0.01~0.21,其中我国南方种群、日本种群与其他种群间分化最大。所有种群可以分为6个遗传单元,包括日本、海南三亚、云南西双版纳、四川攀枝花、中部和东部、北部种群。(4)不同寄主来源的棕榈蓟马种群遗传多样性和遗传结构用微卫星和线粒体基因研究山东省寿光市不同寄主植物上7个种群的棕榈蓟马,发现等位基因数为3~27,期望杂合度和观测杂合度的范围分别是0.4490~0.5684和0.4280~0.5701,近交系数在-0.0022~0.0300之间。不同寄主种群间遗传多样性没有差异,没有明显的种群结构。利用线粒体COⅠ基因数据将7个种群分为4个单倍型,利用微卫星数据对7个寄主相关性种群进行分析发现,种群遗传结构与寄主植物无关。(5)棕榈蓟马种群遗传结构的影响因素基于微卫星数据对地理隔离、气候因素、寄主植物和防控措施等因素对棕榈蓟马遗传结构的影响进行了分析。种群遗传结构与地理距离和气候因素存在明显的相关性,同时与抗性水平也相关,但是与寄主的相关性不明显。
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