在政府机关单位非编人员与在编人员适用两套不同的薪酬计算方式，收入差距明显，早已为社会公众所熟知。在法制建设不断推进的今天，劳动者权益保护越来越受到重视，薪酬歧视问题也越来越受到广泛的关注。作为国家政策的执行者，政府机关单位理应起到模范带头作用，尊重非编人员的劳动价值，努力创造公平公正的用工环境。本文以PY区的乡镇街道机关为例，综合运用文献研究法、调查研究法等，致力于了解基层政府非编人员薪酬歧视问题的真实状况。分别从工资水平、薪酬结构、福利水平、隐性收入、发展机会五个方面比较分析了非编人员与在编人员的薪酬差距。在此基础上进一步论证非编人员的薪酬差距实质就是薪酬歧视。其后，分别从政府因素和社会环境因素两个方面深入分析造成这一状况的原因。最后，本文从短期和长期两个方面提出了解决问题的对策。从短期来看，可以从薪酬标准、薪酬结构、晋升渠道、薪酬管理制度化等方面来加强非编人员的薪酬管理。从长远来看，必须涉及更深入的制度性改革，实施“官”、“员”分类，基层政府的非领导职务取消编制身份差别，实施全员聘任制。