金铁锁(Psammosilene tunicoides W.C.Wu et C.Y.Wu)系石竹科(Caryophyllaceae)单种属植物，为中国西南特有濒危物种为云南白药的主要组成药材之一。由于其长期以来完全靠野生采挖，自然生长及药材蕴藏量有限，资源逐渐减少，现已作为稀有濒危物种列于《中国植物红皮书》中，是国家二级保护植物。本论文以鉴别不同居群金铁锁及其伪品瓦草，构建金铁锁指纹图谱以及扩大金铁锁药用部位，综合利用日益匮乏的金铁锁资源为目的，以金铁锁的ITS序列和鲨烯合成酶为目标，分别采用分子标记技术(ITS)和组织原位杂交技术对其进行研究，主要结果和结论如下：1.金铁锁不同地区的测序结果基本完全相同，只相差1-4个bp，同源性达到99％以上，说明金铁锁不同居群间ITS序列较为稳定。而西藏林芝为分布的最西北端，存在一定的地理隔离，ITS序列与其他居群相差最大，可能是在喜玛拉雅山脉隆起之后变异新分化出的一支。2.金铁锁与瓦草的同源性只有73％，也就是说差异碱基达到了150bp以上，因此能在分子水平将他们区分开，说明利用ITS序列来鉴定和检验金铁锁药材检验伪品瓦草是十分可靠的。3.原位杂交结果显示金铁锁鲨烯合成酶基因的mRNA的表达在金铁锁根中分布于皮层、内皮层、韧皮部，而木质部没有检测到杂交信号。在金铁锁叶中分布于栅栏组织和海绵组织中，而叶脉中没有检测到杂交信号。由此可见金铁锁鲨烯合成酶基因的mRNA存在于薄壁组织中。