基于深度学习的胃癌浆膜浸润判别及迁移应用研究

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:BEYONDPEAKER
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:胃癌浆膜浸润会增大病人发生腹膜播散的风险,导致病人预后不良。当前研究指南推荐浆膜浸润的病人术前接受新辅助化疗,因此术前浆膜浸润的评估结果将决定不同的治疗方式。然而,传统的影像学检查方法如计算机断层扫描(Computed Tomography,CT)和超声内镜(Endoscopic Ultrasonography,EUS)对T分期和浆膜浸润术前判别的准确率并不满足临床需求。其次,针对腹膜转移这一预后较差人群,传统的术前检测腹膜转移的影像学方式如CT检测敏感度较低,无法发现隐匿性腹膜转移。而在发生浆膜浸润的病人中,隐匿性腹膜转移的发生概率高于未发生浆膜浸润的病人的4倍以上。之前的研究表明通过术前CT构建影像组学模型预测腹腔镜探查发现的隐匿性腹膜转移,能够达到很高的准确率,然而目前还缺乏研究对腹腔冲洗液/腹水细胞学检查阳性的病人予以术前或术中准确预测。如果能在术前或术中发现这类病人,并采用恰当的治疗方式(腹腔化疗、腹腔灌洗等)有望提高这类病人的生存率并降低腹膜转移发生率。此外,术中观察浆膜的大体形态可作为腹膜转移的预测因子,然而这种方式需借助于医生肉眼,判断较主观,容易受其他客观因素影响。因此,融合术前CT与术中浆膜照片的预测模型或将提高腹腔冲洗液/腹水细胞学检查阳性的预测精度。在实际临床治疗工作中,浆膜浸润的病人相对于其他病人很可能更值得接受新辅助治疗。准确判别浆膜浸润的模型为我们精准选择新辅助化疗治疗对象奠定了基础,但是并非所有浆膜浸润的病人对新辅助化疗均有明显获益,临床仍然需要进一步寻找预测新辅助化疗疗效的方法。深度学习已在计算机视觉领域中取得了重大突破,并在医学图像处理中获得了广泛应用。新兴的深度学习方法,视觉转换器(Vision Transformer,Vi T)将传统的在自然语言处理(Natural Language Processing,NLP)领域的Transformer扩展到图像分类问题,并在一些领域取得了优于卷积神经网络(Convolutional Neural Networks,CNN)的性能。但是,Vi T在医学图像中的判断能力仍需探索。迁移学习通过从已经学习的相关任务中迁移知识来改进新任务的学习,已成为深度学习中流行的一种优化算法。此外,采用生成对抗网络(Generative Adversarial Network,GAN)对训练集数据进行数据增强可以解决训练集病例数不足的问题。研究方法:本研究首先利用深度学习进行胃癌浆膜浸润术前判别。研究纳入了中国医科大学附属第一医院的2275例病人(训练集2039人,内部测试集236人)和辽宁省肿瘤医院的696例病人,基于研究者和放射科医师手工标注的CT病灶的感兴趣区域(Region Of Interest,ROI),比较了Dense Net-169,Inception-v3,InceptionResnet-v2,Res Net-50和ViT-B/32模型对浆膜浸润的判别效果。随后基于中国医科大学附属第一医院纳入的1928例病人(训练集1720人,内部测试集208人)和辽宁省肿瘤医院纳入的560例病人的CT图像及浆膜浸润与非浸润病人间具有显著差异的术前血液指标,构建了Dense Net-169+C,Inception-v3+C,Inception-Resnet-v2+C,Res Net-50+C和Vi T-B/32+C。将表现最好的CNN模型(Inception-v3+C)和Vi T模型(Vi T-B/32+C)结合,构建了Ensemble Model+C。通过术前CT图像和血液检查指标联合判别浆膜浸润,并在内部和外部测试集中评估了模型的性能。此外,开展可复现性验证实验,另一位肿瘤学学生独立对外部测试集CT图像上的肿瘤区域进行标注,将标注后的ROI输入模型,探索模型效果是否受观察者间偏倚的影响。随后进行生存分析判断模型的预后评估性能。其次,应用迁移学习,将浆膜浸润判别模型迁移至腹腔冲洗液/腹水细胞学检查结果预测中。本研究基于中国医科大学附属第一医院纳入的620例病人(训练集496人,测试集124人)的CT图像和术前血液学检查指标,将第一部分表现最好Ensemble Model+C迁移学习至腹腔冲洗液/腹水细胞学检查结果预测中。为进一步提高准确率,本研究收集了病人的术中胃部浆膜照片,比较了Dense Net-169,Inception-v3,Inception Resnet-v2,Res Net-50和Vi T-B/32对浆膜浸润的判断效果,将模型迁移学习至腹腔冲洗液/腹水细胞学检查结果预测中,并选取了效果最好的模型与术前Ensemble Model+C的判断结果结合,旨在于术中预测腹腔冲洗液/腹水细胞学检查结果。最后,基于原发灶与淋巴结转移灶预测胃癌新辅助化疗疗效。研究纳入了辽宁省肿瘤医院的188例病人和中国医科大学附属第一医院的94例病人的新辅助化疗前CT图像,基于原发灶与淋巴结转移灶的CT图像,采用深度卷积生成对抗网络(Deep Convolution Generative Adversarial Networks,DCGAN)按照1:3比例进行数据增强,基于DCGAN生成的图像采用五种深度学习算法Dense Net-169,Inceptionv3,Inception Resnet-v2,Res Net-50和Vi T-B/32,分别构建新辅助化疗疗效预测模型,并分别将模型迁移学习至原发灶和淋巴结转移灶的真实CT图像中。将原发灶和淋巴结转移灶模型的判断结果结合,计算模型的准确率和AUC值。在Ensemble Model+C的帮助下,判断出浆膜浸润亚组,并评估了模型对浆膜浸润病人化疗疗效的预测作用。采用Cox回归分析了化疗疗效预测模型的预后评估性能。结果:1.胃癌浆膜浸润术前判别本部分首先基于CT图像构建深度学习模型判别浆膜浸润,内部测试集中Dense Net-169达到了89.4%的最高准确率,外部测试集中Inception-v3达到了87.5%的最高准确率。将CT与浆膜浸润相关血液检查指标结合,由Inception-v3+C与Vi TB/32+C联合构建的Ensemble Model+C在测试集中表现最好,内部测试集准确率为91.8%,受试者工作曲线(Receiver Operating Characteristic Curve,ROC)下面积(Area Under Curve,AUC)为0.974(95%CI:0.955-0.992),在外部测试集中准确率为90.9%,AUC为0.950(95%CI:0.931-0.969)。可复现性验证实验表明,Ensemble Model+C的准确率为87.5%。Kaplan-Meier曲线log-rank检验提示Ensemble Model+C判别结果可以预测术后生存(P<0.001)。训练集一致性指数(Concordance Index,C-index)为0.713(95%CI:0.686-0.739),外部测试集的C-index为0.754(95%CI:0.709-0.798)。2.胃癌腹腔冲洗液/腹水细胞学检查结果预测将浆膜浸润判别模型Ensemble Model+C迁移学习至腹腔冲洗液/腹水细胞学检查结果预测任务,在测试集,同时具有术前CT、血液指标及术中浆膜照片的108例病人中,准确率达到了89.8%,AUC为0.952(95%CI:0.907-0.997)。术中胃部浆膜照片可以判别浆膜浸润,并通过迁移学习的方式预测腹腔冲洗液/腹水细胞学检查结果,Dense Net-169的准确率最高(83.3%)。当将二者的判断结合后,预测准确率提高至91.7%,AUC提高至0.965(95%CI:0.934-0.995)。3.胃癌新辅助化疗疗效预测基于胃癌CT原发灶图像预测新辅助化疗疗效,Res Net-50在测试集中达到了81.9%的最高准确率,将原发灶模型与淋巴结转移灶模型的判断结合时,各个模型的AUC值与只考虑原发灶时相比均有提高,其中Inception-Res Net-v2取得了最高的AUC值,为0.918(95%CI:0.859-0.978)。在浆膜浸润病人的亚组中,只考虑原发灶时,Res Net-50达到了81.2%的最高准确率,将原发灶和淋巴结转移灶模型的判断结合后,Inception-Res Net-v2的AUC为0.902(95%CI:0.832-0.972)。结论:1.Ensemble Model+C基于CT图像和血液检查指标在术前判别胃癌浆膜浸润方面具有良好的性能,模型同时能实现生存预后评估。2.Ensemble Model+C可采用迁移学习的方式,与术中浆膜照片深度学习模型结合,在术前或术中预测腹腔冲洗液/腹水细胞学检查结果。3.可基于胃癌原发灶与淋巴结转移灶分别构建深度学习模型,结合二者的判断结果可实现胃癌新辅助化疗疗效预测。
其他文献
<正>高考历史选择题重点考查了学生对于史料(包括文字、图片、漫画等)的理解和分析能力,这也是高中历史核心素养中历史解释的要求。对于同一则史料,学生可能会存在不同的理解方式,命题人往往喜欢利用学生对于史料理解上的“偏差”命制干扰选项。因此,引导学生识别“雷区”,排除干扰选项是重中之重。笔者通过对选择题的研究与分析,认为干扰选项主要包含三大类别,即说法错误、
期刊
目的:膀胱癌作为泌尿系统中较为高发的肿瘤之一,治疗后复发率极高,给患者带来了沉重的精神和经济负担。其中非肌层浸润型膀胱癌可占到初发膀胱肿瘤的70%,而对其主要的治疗手段为手术结合膀胱腔内辅助灌注治疗。术后早期和维持膀胱灌注化疗可通过杀伤创面残留的肿瘤细胞以降低肿瘤复发率。然而,膀胱癌原发性或者获得性耐药的产生常常导致化疗疗效不佳,甚至出现长期应用某种化疗药物后出现对其他多种化疗方案也产生抵抗的多药
学位
报纸
目的:细胞迁移是机体生长、发育过程中的基本生物学现象,参与人类胚胎发育、组织再生、伤口愈合和肿瘤转移等多种生理、病理过程。细胞在电梯度的引导下进行定向迁移的能力被称之为“趋电性”。研究证实,电信号作为引导细胞进行定向迁移的信号之一,其优先级别超过了其他共存的信号。因此,细胞趋电性一直以来是各国学者研究的热点。脂肪源性干细胞(Adipose-derived stem cells,ADSCs)是从脂肪
学位
目的:骨关节炎(Osteoarthritis,OA)是世界范围内最为常见的骨关节疾患,不仅对患病者个人及家庭造成了很大的影响,对于卫生保健体系和社会经济也带来了沉重的负担。随着全球人口老龄化程度的增加、肥胖人群的增多和关节损伤患者数量的增长,OA的发病变得更加普遍,据估计目前全球约有2.5亿人受到骨关节炎的影响。但在如此沉重的负担下,大部分骨关节炎患者并未得到适当的治疗。骨关节炎是一种复杂的慢性疾
学位
目的:肺腺癌在非小细胞肺癌中占比最高。研究表明,lnc RNA HOXA11-AS在许多肿瘤中表达异常,在肺腺癌中高表达。HOXA11-AS在肺腺癌糖酵解中的作用备受关注,但尚未完全阐明。本研究旨在通过体内实验和体外实验来探究HOXA11-AS在肺腺癌增殖和糖酵解中起到的作用及机制,并通过Micro-PET分子影像技术,直观地显示沉默HOXA11-AS之后裸鼠肺腺癌移植瘤对18F-FDG摄取的变化
学位
报纸
<正>概念是由具象到抽象的桥梁。新一轮课程改革着力发展学生的核心素养,利用核心概念进行历史教学是发展学生学科核心素养的必要路径。什么是核心概念呢?刘炳瑛从哲学角度指出,核心概念是"从感性认识所提供的关于事物的各种属性和具体形象中,抽象概括出共同的本质而形成的认识"。(1)林恩·埃里克森从教学论一
期刊
目的:融合技术已广泛应用于脊柱外伤、退行性疾病等外科治疗,但是仍存在融合失败、内固定物折断、假关节形成等并发症。而且传统椎弓根螺钉棒系统、椎间融合器对邻近节段也产生长期影响。据报道融合后生物力学改变引起邻近节段退变(adjacent segment degeneration,ASD)的发生率超过30%。通常认为ASD的发展与融合邻近节段的代偿性过度活动有关。邻近节段载荷分担的指标包括椎间盘内压力和
学位
背景:铁是人体内最丰富及维持机体生命活动必需的微量元素之一,在DNA的合成、电子传递、氧运送等生命代谢过程中起着重要的作用。正常细胞铁代谢处于一个不断吸收、利用、储存、循环的动态平衡中,即铁稳态,其在维持细胞的正常生理功能中具有重要意义。当细胞中铁稳态遭到破坏,就会导致细胞内铁过载。过量的铁通过芬顿(Fenton)反应产生活性氧可以诱导细胞发生一种不同于凋亡、自噬、坏死的程序性细胞死亡方式——铁死
学位