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1996年我们利用返回式卫星搭载水稻纯系种子五优稻一号（971ck），经过常规育种筛选，获得了稳定遗传的诱变品系971-5。该诱变品系具有良好的可稳定遗传的突变性状：中早熟品系，抗逆性强，活杆成熟，整齐度好，并通过黑龙江省农业科学院的品种鉴定，命名为五工稻一号。在前期工作中，赵海城老师采用AFLP分子标记技术对诱变品系971-5及其地面对照971ck在基因组水平进行突变分析，随机选取64对引物，在其中的16对引物中筛选到31个突变位点。接着我们又对神州3号搭载获得的15个诱变水稻品系的二代单株，及10个对照和2个远缘品种进行了AFLP分析，结果发现空间诱变产生的基因组突变位点大多数位于品种之间的多态性位点上。 为了进一步研究空间诱变水稻品系的基因组突变特性，本实验选取分别在产量、稻瘟病抗性和株高上发生改变的空间诱变品系971-5、972-4和R955及其地面对照971ck、972ck和丙95-503作为实验材料，另外还选取了8个远缘粳稻品种：五稻三号、下北、R132、台北309、越光、红珍珠、莲粳一号、莲粳二号及3个籼稻品种TA129、TA130、TA146，共17个水稻品种。用前期工作中筛选的16对AFLP引物对这17个水稻品系进行基因组分析，共检测到1251个位点，平均每对引物扩增80个左右位点，其中59.6％（745）对所有品系为多态性位点。16对引物组合在971-5与对照971ck，972-4与对照972ck，R955与对照丙95-503之间分别检测到54、86、5个突变位点，故三个品系的突变率分别为4.3%、6.9%、0.4%。971-5的54个突变位点及972-4的86个突变位点中均有13个位于基因组的稳定区域或为突变特异性位点，故突变位点中分别有75.9%和84.9%位于多态性位点上。而在R955与对照丙95-503中检测到的5个突变位点100%位于品种间的多态性位点上。这一发现显示空间特殊环境因子导致水稻基因组的突变位点主要位于品种间的多态性位点上，这些可能为基因组上的突变热点区域；并且空间特殊环境与地面自然条件可能具有相同的诱变分子机制。