“马太效应”是一种“损不足，补有余”的社会学现象，它首先由美国著名的科学社会学家罗伯特·默顿提出来。之后，人们也就在默顿的科学社会学的视野的基础之上，从政治、经济、教育等方面来研究“马太效应”。中国有关“马太效应”的研究中，有的是对默顿研究成果的回顾与展望，有的是把它作为一种制造不平等现象的代名词。 本文试着对科学研究中的“马太效应”和社会的科学能力的关系进行研究，通过对社会的科学能力和“马太效应”的内部结构及运行机制的分析，能使人们十分清晰地看到，在现今的大科学时代，在我国大力创建创新型国家的过程中，不是有效地对“马太效应”达到了趋利避害的效果，而是使它愈演愈烈。对此所得出的结论是，从某种意义上说在科学研究系统中，“马太效应”带给我们更多的是喜而不是忧。 此外，利用系统科学理论，把“役使原理”作为“马太效应”的科学基础，具体探讨科学研究中的“马太效应”与社会科学能力之间的关系问题。它们二者自身各存在着正反馈机制，进一步的研究发现它们之间既存在着一种超级正反馈机制，又存有负反馈机制。在如今的大科学时代，二者之间的超级正反馈机制相对于负反馈机制来讲表现得更为突出。 最终，借用本论题的研究成果重新审视科学进步模式和我国目前的创新型国家建设这两个问题。对于困难重重的科学进步模式来说，虽然并没有从根本上改变它所面临的困境，但是却转变了原来的理论视角；而对于创新型国家建设而言，也可以提出些许可供参考的建议。