基于多模态MRI的放射组学特征和深度特征融合的胶质瘤分级分析

来源 :南方医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Lyben
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
胶质瘤是脑部最常见的原发性恶性肿瘤,占所有恶性脑肿瘤的80%。胶质瘤可分为胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)和较低级别胶质瘤(lower-grade glioma,LGG)。GBM和LGG的准确分级对患者治疗计划的制定和预后判断至关重要。目前临床上胶质瘤分级的金标准是基于手术活检后的组织病理学诊断,但手术活检存在侵入性、不及时性及耗时长等问题。磁共振成像(magnetic resonance imaging,MRI)技术是临床诊断中一种无创的辅助手段,能够提供肿瘤结构及功能信息,在胶质瘤分级中发挥着重要作用。当前许多研究利用MRI进行胶质瘤分级分析,但都局限于使用单一方法学。在本文的研究中,我们基于多模态MRI,探究放射组学特征和深度特征融合的混合结构在胶质瘤分级中的可行性。本研究主要提出了两种基于多模态MRI的放射组学特征和深度特征融合的胶质瘤分级框架。研究方法一使用多模态MR图像的2.5D正交平面(即矢状面、冠状面和横断面)作为输入;利用放射组学和深度学习两种算法分别对三个正交平面图像提取放射组学特征和深度特征;采用特征袋算法分别对每个正交平面图像的两类特征进行编码,使得特征更紧凑并实现高维稀疏表示;使用核融合策略对三个正交平面图像进行融合,从而获得三个正交平面图像特征的统一表示;最后,基于两种特征的融合构建SVM分类器用于胶质瘤分级。研究方法二使用多模态MR图像的3D感兴趣区域作为输入;利用放射组学模型提取肿瘤的全局特征和深度学习算法提取局部特征;采用Relief算法分别对全局特征和局部特征进行特征选择,从而缓解过拟合问题;使用核融合策略结合不同模态的全局放射组学特征和局部深度特征;最后,建立一个基于不同特征融合的SVM用于胶质瘤分级。实验共纳入来自两个数据集的567例患者,其中一个为TCGA数据集(GBM=106,LGG=127),分为训练集(GBM=85,LGG=101)和内部验证集(GBM=21,LGG=26)用来训练模型和选择参数;另一个为当地医院数据集(GBM=105,LGG=229),作为独立的外部测试集用来评估模型的泛化性能。所有患者均接受T1加权对比度增强(Tlce)和T2液体衰减反转恢复(T2FLAIR)MRI扫描。实验结果通过受试者工作曲线下面积、敏感性、特异性、t检验对模型的性能进行评价。结果表明,两种方法在内部验证集和外部测试集中都表现了显著的泛化能力,方法二的性能稍优于方法一,且两种方法都优于仅基于放射组学特征或深度特征的单一方法,预测结果也与临床放射医生的诊断性能相当。本研究证实了基于多模态MRI的放射组学特征和深度特征融合以开发一种无创的胶质瘤分级模型的可行性。
其他文献
研究目的:1.羧甲基壳聚糖-锶复合物的制备及表征;2.研究羧甲基壳聚糖-锶复合物对于软骨细胞的生物学功效;3.探讨羧甲基壳聚糖-锶复合物在动物体内的整体疗效。研究方法:1.利用锶离子螯合羧甲基壳聚糖的作用合成羧甲基壳聚糖锶。2.SEM/EDS用于分析羧甲基壳聚糖-锶颗粒微观形态和元素构成;FTIR对锶离子可能结合的官能团进行分析;XRD用于检测羧甲基壳聚糖-锶的化学合成性能。AFM用于检测羧甲基壳
研究目的:运动有益于身心健康,已有研究表明长期的运动锻炼会对大脑的结构产生影响,进而影响人体相关的认知功能。拳击训练及军事体能训练属于较为特殊的运动方式,目前尚缺乏研究探讨拳击训练及军事体能训练是否会对大脑的结构产生影响,进而导致认知功能的改变。因此,研究这两种运动方式是否会对大脑结构产生影响具有一定的现实意义和临床价值。本课题拟通过结构磁共振技术研究拳击运动和军事体能训练是否会对大脑产生刺激,激
研究目的急性脑梗死的病情预测一直是神经科关注的问题,简易有效的预测指标对脑梗死的病情预测有重大意义。探讨急性脑梗死患者的血液红细胞体积分布宽度和血小板计数比值(RPR)与急性脑梗死发病及梗死体积的相关性,为急性脑梗死的诊断、病情严重程度的预测及处理提供一定的帮助。研究方法回顾性纳入2017年1月-2020年7月中国人民解放军总医院第六医学中心发病7天以内的住院急性脑梗死患者119例,所有病例经头颅
学位
目的1.调查结直肠癌患者术后早期(<6个月)肠造口周围潮湿相关性皮肤损伤的发生率,分析其危险因素并构建风险预测模型,根据该模型绘制列线图和初步开发手机应用程序(APP)。2.对构建的结直肠癌患者术后早期(<6个月)肠造口周围潮湿相关性皮肤损伤风险预测模型进行内部验证、外部验证和临床有用性评价。方法1.选取2019年10月~2020年11月广州市某三级甲等医院伤口造口门诊305名患者作为研究对象,最
目的:探讨经皮肾镜碎石取石术(percutaneous nephrolithotomy,PCNL)后肾假性动脉瘤出血的危险因素,以及床旁彩色多普勒超声诊断经皮肾镜碎石取石术术后肾假性动脉瘤出血的临床应用价值。方法:对2017年11月至2020年11月在南方医科大学南方医院泌尿外科诊断为肾结石并行PCNL术的患者临床资料,共365例,其中有11例为肾假性动脉瘤出血进行回顾性分析,分别从患者的一般资料
研究背景:颅内静脉血栓形成(cerebral venous thrombosis,CVT)是脑血管疾病中罕见且尚未被充分认识的类型,大约占所有卒中类型的1%。它常发生于青壮年,尤其多见于育龄期女性。男女患病比例约为1:3。近年来,各地区的临床研究发现颅内静脉血栓形成的发病率较以往有明显的升高。2011年指南提出的颅内静脉血栓形成的年发生率为2-5例/100万人,而近几年的研究表明颅内静脉血栓形成的
背景前列腺癌是男性泌尿生殖系统中最常见的恶性肿瘤之一,其发病的危险因素尚不明确,目前认为年龄、种族、家族史和遗传易感性是内源性危险因素,此外环境和饮食因素可能也与前列腺癌患病风险有关。遗传易感性跟前列腺癌的发生息息相关,其中单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)是遗传易感性的重要物质基础之一。目前已通过全基因组相关研究确定了 100多个常见的前列
第一部分 筛选头颈鳞状细胞癌的核心基因并进行临床预后评价背景和目的:头颈部恶性肿瘤是困扰耳鼻喉科医生的难题,鉴定新的生物标志物是头颈恶性肿瘤诊断、治疗以及预后的迫切需要。方法:本研究中,在癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas TCGA)数据库下载基因表达数据以及临床数据,在基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载基因芯片数据集GSE
视黄醇对皮肤具有祛斑抗皱、祛痘、抗衰老的作用。但作为化妆品原料,视黄醇存在许多缺点和局限性——初次使用会带来烧灼感、结痂、脱屑等刺激反应,容易氧化变性。因此,为弥补视黄醇及其衍生物的缺陷,研究者利用微胶囊、胶束、凝胶等载体对其进行包载,缓解视黄醇对皮肤的刺激,延长了视黄醇产品的使用寿命。对视黄醇及其衍生物的载体结构和它们在化妆品中的应用进行了介绍。