现代大学制度建设主要包括两个方面的建设,一是以理顺政府、大学、社会之间的关系为着眼点,由外向内的建设,另一方面是以大学内部治理为突破口,由内向外的建设,主要表现为大学的内部,即一所大学内部的组织结构和运行机制,包括内部决策体制、运行管理体系、大学成员规范体系等构成,反映大学的办学意志和学术特点。由于受我国大学传统的内部体制和历史文化传统影响,我国大学的内部组织构架和管理模式,存在浓重的政府行政管理色彩,难以反映大学作为学术组织的基本属性。以大学内部治理结构为视域提出问题和分析问题,通过对现代大学制度的历史考察和理论思考,比较了典型国家大学内部治理结构的模式及存在形式,分析了我国大学在现代大学制度建设内部治理结构中存在的问题,在此基础上,对基于内部治理结构的中国现代大学制度建设的基本原则及主要内容进行了构建,并且从治理理念、领导体制、运行管理机制、大学章程等层面提出了对策建议,即明确大学的决策体制,改革大学的内部管理制度,注重学术环境建设,完善大学章程建设等,以期为现代大学制度建设提供理论和实践借鉴。