干旱胁迫马铃薯叶片转录组分析

被引量 : 15次 | 上传用户:bonbonty
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
我国是世界主要的干旱国家之一,干旱半干旱地区占国土面积的47%,占总耕地面积的51%[1]。干旱造成的作物减产超过其他逆境造成减产的总和[2],因此我国早已把抗旱性研究作为重点。马铃薯是典型的温带作物,对水分亏缺非常敏感,干旱将影响马铃薯正常生长发育和后期产量的形成,成为马铃薯产业发展的限制因素。因此,应对马铃薯的干旱危害及抗旱性机制进行全面而系统的研究并采取行之有效的措施,提高马铃薯的抗旱性确保马铃薯的高产稳产。为了深入了解马铃薯的抗旱分子机制,本研究以马铃薯“陇薯3号”叶片为试验材料,采用Solexa高通量测序技术建立了马铃薯叶片转录本数据库并进行了相关分析;并采用qRT-PCR技术检测马铃薯抗旱相关基因的表达模式,以揭示马铃薯抗旱分子机制。本研究取得以下结果:1.对“陇薯3号”进行干旱处理,提取RNA,Solexa测序分析获得了86,965,482个RNA测序数据,在转录水平上检测和定量到7284个基因,干旱处理叶片富集6754个基因,对照叶片富集6419个基因。其中,上调表达基因有842个,下调表达基因有494个;2.干旱处理和对照叶片差异表达基因主要富集在89个基因类别和21个KEGG途径中,这些结果为筛选马铃薯抗旱相关基因提供了广泛的候选基因,对于解析马铃薯抗旱分子机理具有重要的意义;3.选择Solexa测序中log2(fold change)≥11倍的22个差异基因,包括6个转录因子、4个脯氨酸代谢、4个抗氧化防御系统、4个类黄酮生物合成和4个植物激素信号转导相关基因,采用qRT-PCR检测20%PEG6000处理0h(对照组)、1h、6h和12h后马铃薯叶片中22个基因表达的变化。研究表明:被检测的22个基因的结果与Solexa高通量测序的结果一致,并且在不同干旱处理时间下各基因表达各不相同,表现出5种表达模式:上调-上调-上调、下调-下调-下调、上调-下调-上调、上调-下调-下调、上调-上调-下调。本研究为深入开展马铃薯抗旱机理和抗早基因的研究奠定了基础。
其他文献
为数不少并成系统的合音词是宁波方言词语的突出特征之一。从语音角度看,宁波方言合音词基本采用反切的方法但又有个别特殊变异;从语用角度分析,宁波方言的合音词均为日常生活口
本文首先把近百个后置词划分为12个语义、功能类别,进而探讨了后置词的定义及语法化、词汇化以及与前置成分的三种配对关系、后置词的多种功能等。此外,还探讨了后置词的连用
现象学作为一种新型的描述方法,在概念和实在之间,事实和本质之间,建立了思想的通道。这一方法的基点是从客观世界的设定回返到现象的基地上来。在"传媒"这个概念与传媒指称
确定形容词AA式重叠所表示的量关键是看跟谁比 ,我们认为不存在一个稳定的比较对象和一致的标准 ,而应根据具体情况确定比较对象 ,并且认为参照量和变量都是模糊量。从这个观
互联网技术的发展给视频新闻传播带来巨大冲击,将网络技术同传统的电视媒体相结合,极大地扩展了视频新闻的传播空间。在研究了电视媒体视频新闻传播系统的基础上,建立了基于
岩土工程反分析是岩土力学一个重要分支,发展至今,已有30余年历史,形成了可供工程实践采用的理论和方法体系。但对于大多数工作在岩土工程建设第一线的广大设计与施工人员来
边坡动力问题是一个涉及多学科的难题,对其进行的研究还很不成熟。而我国又是一个多地震的国家,地震导致边坡失稳引发的地质灾害非常严重。随着我国经济建设的飞速发展,高等
由不同时相和不同传感器所导致的遥感数据非一致性是定量监测地表长期变化所必须面对的一个重要问题。用于消减遥感数据非一致性的归一化辐射校正和传感器交叉定标,多采用统
应用《台风年鉴》1953—2012年热带气旋(TC)最佳路径资料,统计分析了影响广西沿海TC和易引发广西沿海显著增水的TC的时空分布特征以及年际变化特征。结果表明:影响广西沿海的
对开曼群岛离岸金融中心的形成与发展过程、离岸机构与业务的内容、特点进行了分析;开曼群岛离岸金融中心的形成是全球政治经济格局变动下资本的国际运动与特定环境相结合的