灵昆鸡CRBP4、OCx-32、VLDLR和CTSD基因与产蛋性状的关联分析

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本研究对F3、F4两世代灵昆鸡的300日龄产蛋量、500日龄产蛋量和300日龄蛋品质共11个性状进行了分析;并选择与产蛋性状密切相关的细胞视黄醇结合蛋白(Cellular retionol-binding protein4,CRBP4)、蛋壳基质蛋白(Ovocalyxin-32,OCX-32)、极低密度脂蛋白受体(Very low density lipoprotein receptor,VLDLR)、溶酶体组织蛋白酶(Cathepsin D,CTSD)为研究对象,通过DNA直接测序法检测其单核苷酸多态性位点(Single nucleotide polymorphism site,SNPs);并分析灵昆鸡CRBP4、OCX-32、VLDLR和CTSD基因多态性与产蛋性状的相关性,寻找灵昆鸡产蛋性状分子标记辅助育种的候选基因,为灵昆鸡选育工作提供理论依据。得到了如下结果:  1.对F3、F4两世代灵昆鸡的300日龄产蛋量和500日龄产蛋量进行了统计,对300日龄蛋品质性状进行了测定,比较两世代产蛋性状发现,300日龄产蛋量和蛋黄比率存在显著差异(P<0.05),蛋壳厚度、蛋黄颜色、哈氏单位存在极显著差异(P<0.01),其他性状差异不显著。  2.对F3、F4两世代灵昆鸡的产蛋性状分别进行了相关性分析,结果发现在两个世代中,300日龄产蛋量与500日龄产蛋量呈极显著正相关(P<0.01);蛋壳强度和蛋壳厚度呈极显著正相关(P<0.01);哈氏单位和蛋白高度呈极显著正相关(P<0.01);蛋黄重与蛋黄比率呈极显著正相关(P<0.01)。  3.共检测了12个多态位点:CRBP4的3个多态位点A337C、G2727A、A2847G,OCX-32的3个多态位点G6566A、A6612G、A6760T,VLDLR的1个多态位点C13444T,CTSD的5个多态位点T2614C、C9445T、C9457T、C9475T、T11028C。其中C13444T、C9457T、T11028C位点偏离了Hardy-Weinberg平衡状态,其余9个位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。  4.CRBP4基因第2、5外显子SNPs:最小二乘法分析表明,A337C位点AA基因型和AC基因型个体300日龄产蛋量显著高于CC基因型(P<0.05)。G2727A位点和A2847G位点,GG基因型蛋重显著高于AA基因型(P<0.05),GG基因型对蛋形指数的影响显著高于AA基因型(P<0.05); GG基因型对蛋白高度的影响显著高于AA基因型(P<0.05)。  5.OCX-32基因第5外显子SNPs:最小二乘法分析表明,A6566G位点AA基因型个体蛋白高度显著高于GG基因型(P<0.05)。A6612G位点和A6760T位点,GG基因型个体的蛋黄重显著高于AG基因型(P<0.05)。  6.VLDLR基因的C13444T位点:最小二乘法分析表明,C13444T位点对哈氏单位、蛋黄重、蛋黄比例显著相关(P<0.05);在哈氏单位方面,ZTW型个体均值显著高于ZCW型个体均值(P<0.05);在蛋黄重和蛋黄比率方面,ZCW型个体均值显著高于ZTW型(P<0.05)。  7.CTSD基因第3、7、9外显子SNPs:最小二乘法分析表明,T2614C位点CC型和CT型在蛋白高度上显著高于TT型(P<0.05); TT基因型哈氏单位显著高于CT基因型(P<0.05)。C9445T位点和C9475T位点对500日龄产蛋量和蛋重有显著影响(P<0.05),CC基因型个体均值显著高于CT基因型(P<0.05)。C9457T位点CC基因型蛋重显著高于TT基因型(P<0.05)。T11028C位点CT基因型蛋白高度显著高于TT基因型(P<0.05)。
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