免征农业税是中国历史上破天荒的一件大事，几千年皇粮国税一朝免征，意义深远重大。但是取消农业税只是农村税费改革的第一步，最关键的还是如何建立一套较为体现公平的完善的城乡统一的税制体系。何况目前我国正处于改革的攻坚阶段，取消农业税后建立一个完善的缩小城乡差距的税收制度是很迫切的。讨论建立城乡统一税制体系，就需要在宏观上考虑目前我国的税收结构问题，尤其是要先考虑一国的税制取向问题，合理安排各种税种的比重关系。 自二十世纪八十年代以来，国际上税制改革连绵不断，税收结构亦备受关注。如何优化税种结构，使税收做到公平和效率的契合，更好地实现税收功能和国家政策意图；如何设置税种结构才能更好地适应一国政治、经济发展的需要，这是税收研究的热点。税收结构的研究，有助于合理配置税种，优化税制，发挥税收应有的功能。而在税收结构研究中直接税和间接税的关系，即所得税与流转税的关系，是税收结构研究的主要问题之一，正确处理直接税与间接税的关系，是经济结构复杂、实行复合税制的国家实现税收的财政职能和调控职能的主要课题。 在现实中，税种结构优化经常表现出变动性和多样性，但是这并不意味着税种结构优化是不可捉摸的，税种结构优化仍然存在着某些有规律的东西。本论文尝试从数理经济的角度出发，分别从实证和理论推断两方面来探讨税收结构，期望得到有益的结论。首先，从实证角度出发，文章分别建立了流转税制和所得税制下中国六部门的税收CGE模型，用不动点的方法计算出两种情况下均衡解，进而比较农业税减免后模型达到静态均衡时两种税制的利弊，从中试图找到税种结构的发展方向。其次，文章从理论的角度出发，考虑到就一个国家而言，税种结构优化是一个动态过程，而不是一个静止的状态。因此本文接下去运用动态可计算非线性投入产出模型，从全社会整体福利角度出发，计算当模型达到动态均衡时税种最优比例，从而分析我国的最优税收结构的影响因素问题。论文的研究工作将有助于为政策的制定提供依据。 论文总共分为六章进行阐述，第一章说明本论文的选题依据、国内外研究动态和论文的创新点。第二章是税收理论和税收政策综述。第三章阐述了可计算一般均衡模型的定义、发展应用及模型求解的原理。第四章是两种税制下考虑农业税的可计算一般均衡模型的建立、计算及政策建议。第五章是根据动态可计算非线性投入产出模型计算两种税种的最优税收比例并且进行经济政策分析。第六章是结束语。