术后颅内感染患者预后相关因素分析及感染脑脊液circRNA筛选

来源 :郑州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:joelin0725
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研究目的:临床研究部分通过收集神经外科术后颅内感染患者病例资料,回顾性分析神经外科术后中枢神经系统感染患者预后相关各临床影响因素,旨在指导临床治疗及改善感染患者预后。实验室研究部分通过检测颅内感染患者的脑脊液,研究感染脑脊液中显著性差异表达的circRNA指标,并利用生物信息学技术分析其可能作用机制;以期将其作为颅内感染的脑脊液实验室诊断的生物标志物,旨在早期明确诊断、早期治疗以改善感染患者预后。研究方法:临床研究部分,纳入了113例神经外科手术后确诊为中枢神经系统感染的患者,将病例中多个相关临床因素纳入单因素分析,其中变量的分析方法分别采用相应的统计学分析方法(t检验、秩和检验、卡方检验、Fisher’s精确检验),而后将有显著性差异的影响因素再进行多因素分析(logistic回归分析),最后分析出神经外科术后中枢神经系统感染患者预后相关的临床影响因素。实验室研究部分,纳入了33例神经外科手术后确诊为中枢神经系统感染的患者,并收集其感染状态及非感染状态的脑脊液;第一步,利用基因芯片技术,检测3例患者的术后颅内感染患者感染状态及非感染状态的脑脊液,筛选出感染脑脊液中显著性差异表达的circRNA指标,并数据分析,挑选出候选的供验证用14个circRNA指标;第二步,利用qRT-PCR技术,选用基因芯片实验所用的原样本,验证14个候选circRNA指标,并数据分析,挑选出供扩大样本验证用3个候选circRNA指标;第三步,利用qRT-PCR技术,选用收集的30例患者的脑脊液标本,验证3个候选circRNA指标,将其作为颅内感染的实验室诊断生物标志物;最后利用生物信息学技术分析其可能作用机制。结果:临床研究部分,纳入了年龄、原发病、感染相关手术时间(小时)、感染相关手术次数、是/否急诊手术、感染前引流管放置时间(天)、应用治疗抗生素时间(天)、治疗抗生素数目、脑脊液白细胞数(×106/L)、脑脊液红细胞数(×106/L)、脑脊液红/白比、脑脊液单核细胞百分比(%)、脑脊液多核细胞百分比(%)、细菌培养(被归类)、细菌培养数目、脑脊液生化糖(mmol/l)、脑脊液生化蛋白(mg/1)、脑脊液氯(mmol/1)、感染持续时间(天)等因素进行单因素分析;分析结果显示是/否急诊手术、感染相关手术次数、感染前引流管放置时间(天)、治疗抗生素数目、应用治疗抗生素时间(天)、脑脊液中白细胞数(106/L)、脑脊液生化糖(mmol/1)、脑脊液生化蛋白(mg/1)、细菌培养(被归类)、细菌培养数目、感染持续时间有显著性差异影响(P<0.05);将单因素分析有意义的影响因素纳入Logistic分析,得出结论,感染前引流管放置时间(b:-0.113,OR:0.893,95%CI:0.805-0.991,P:0.033)、治疗抗生素数目(b:-1.470,OR:0.230,95%CI:0.072-0.738,P:0.013)、脑脊液中白细胞数(b:-0.016,OR:0.984,95%CI:0.970-0.998,P:0.027)均为治愈的危险因素;应用治疗抗生素时间(天)(b:0.176,OR:1.193,95%CI:1.063-1.339,P:0.003)为治愈的保护因素。实验室研究部分,第一步,利用基因芯片技术,发现了 214种在感染脑脊液中存在显著性差异表达的环状RNA,其中有72种环状RNA呈上调表达,142种呈下调表达;通过数据分析,选择差异倍数大的,同时结合P值符合显著性差异的要求,纳入验证实验的circRNA指标14个,上调circRNA是hsacircRNA402768,hsacircRNA402632,hsacircRNA061260,hsacircRNA048410,hsacircRNA048148,hsacircRNA402482;下调的circRNA 是hsacircRNA055243,hsacircRNA101900,hsacircRNA405481,hsacircRNA007059,hsacircRNA101366,hsacircRNA102213,hsacircRNA008636,hsacircRNA-009012。第二步,利用 qRT-PCR 技术,选用基因芯片实验所用的原样本,验证了 14个候选circRNA指标,选择原样本验证结果中表达差异倍数比较大,P值比较小的circRNA,作为有显著表达差异意义的候选的扩大验证circRNA指标,上调的circRNA选择的是hsacircRNA402632,在下调的 circRNA 中,选择的是 hsacircRNA008636 和hsacircRNA405481;共三个circRNA指标进行扩大样本的验证实验。第三步,利用qRT-PCR技术,进行扩大脑脊液标本的验证实验,验证的三种circRNA结果中,其中上调的circRNA指标1个为:hsacircRNA402632表达差异倍数2.065(P:0.0008),hsacircRNA008636 表达下调,差异倍数为 0.416(P:0.0001),hsacircRNA405481 表达下调,差异倍数为 0.452(P:0.0002),这 3 种 circRNA的功能尚不清楚,进行了生物信息学分析,FoxO和AMPK信号通路是hsacircRNA008636最重要的通路,推测hsacircRNA008636可能与氧化应激和炎症反应有关,hsacircRNA008636在颅内感染的诊断中具有广阔的应用前景,关于hsacircRNA402632,胰岛素抵抗途径可被富集,而关于hsacircRNA405481,子宫内膜癌信号途径、Fc-epsilon-RI信号途径和TGF-beta信号途径可被富集,均具有诊断颅内感染的潜力。结论:临床研究部分得出结论,随着感染前引流管放置时间、治疗抗生素数目、脑脊液中白细胞数的数值上升,转归越容易出现恶化,随着应用治疗抗生素时间数值上升转归越容易出现治愈。实验室研究部分得出结论,表达上调的circRNA指标:hsacircRNA402632,表达下调 circRNA 指标:hsacircRNA008636、hsacircRNA405481,均有作为神经外科术后颅内感染患者脑脊液实验室诊断的生物标志物的潜力,并通过一些可能的作用机制在颅内感染中发挥作用。
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