三峡库区自2003年开始蓄水以来，水环境问题也随之产生。随着点源污染逐步得到控制，非点源污染已成为成为对水体影响最大的污染源。因此，对三峡库区非点源污染进行模拟，了解三峡库区非点源污染分布特性并对其进行控制区划，从而有针对性的给出污染治理的可行措施，对三峡库区水生、陆域环境的保护具有重要意义。　　本文采用SWAT模型对三峡库区的非点源污染进行了模拟研究。在确定了SWAT模型在三峡库区的适用性之后，探讨了库区非点源污染负荷的年平均总量、在时间和空间上的分布情况，以及各土地利用类型对非点源污染负荷产出的贡献;对库区的非点源污染进行了区域划分;分别对拟采用的各种控制措施进行了模拟分析，最后在此基础上提出了库区的非点源污染控制方案并模拟分析最终效果。　　采用库区流域的数字高程图、土地利用图、土壤类型图和土壤化学属性数据、气象数据库区等构建SWAT模型，并对其进行校验，最终校验结果可基本满足模型的模拟需要。在完成模型校验之后，利用模型的模拟结果从污染物输入总量、空间分布现状、时间分布以及不同土地利用类型的污染负荷对库区非点源污染现状进行了分析。分析结果表明:经SWAT模型计算三峡库区泥沙、总氮、总磷的输入总量分别为0.724亿t/a、8.82万t/a和1.76万t/a;泥沙、TN和TP负荷变化跟库区的降雨量的时间的变化较为一致;最后对不同土地利用类的污染负荷进行分析后得出，库区泥沙、TN和TP污染负荷总量产出最大的是耕地，而单位污染负荷则是裸地和耕地。　　对库区进行非点源污染控制区域划分。将其划分为7个控制区域:水土流失+农业管理措施重点控制区、水土流失+农业管理措施次重点控制区、水土流失+农业管理措施关注区、水土流失次重点控制区、水土流失关注区、农业管理措施次重点控制区、农业管理措施关注区。同时，从全流域土地利用调整（退耕还林和裸地修复）、农业管理措施调整（全流域免耕和有针对性的减少施肥量）、缓冲带/植被过滤带（不同VFSRATIO值和不同坡度）等角度进行了不同非点源污染控制措施的模拟，并分别对其进行分析评价。　　针对所划分的非点源污染控制分区，制定非点源污染控制方案，并对其效果进行评估，最终结果表明:对各需要控制的子流域采取了相应控制措施后库区的泥沙输入总量减少到了0.425亿t/a，比原来减少了41.2％;总氮由原来的8.83万t/a减小到了4.91万t/a，削减率为44.34％;总磷则由原来的1.76万t/a削减到了1.09万t/a，削减率为37.69％。