ATP1B4和FBXO42基因与中国汉族帕金森病的相关性研究

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目的:系统的检测中国汉族帕金森病(Parkinson’s disease, PD)患者ATP1B4(the ATPase Na+/K+transporting beta4polypeptide gene)基因全部编码区的所有变异,分析这些变异的基因型和等位基因频率在中国汉族PD患者组和正常对照组之间分布是否有差异,明确ATP1B4与中国汉族PD发病的相关性。方法:首先对100例PD患者的ATP1B4基因全部编码区及部分非编码区用聚合酶链式反应-单链构象多态性(Polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism, PCR-SSCP)结合测序的方法进行筛查并确定变异类型。然后用统计学方法分析已发现变异的基因型与等位基因频率在202例PD患者组及400例与患者匹配的正常对照组间的分布差异。结果:由于ATP1B4基因位于X染色体上,统计学分析时将男女分开统计。筛查100例PD患者发现一个变异rs2072452(c.143T>C),统计学分析发现该变异的基因频率、等位基因频率在100例女性PD患者和200例女性对照间,102例男性患者和200例男性对照之间的分布均无统计学差异。结论:ATP1B4基因编码区的变异与中国汉族PD的发病无关。目的:筛查中国汉族帕金森病(Parkinson’s disease, PD)患者FBXO42(F-box protein42gene)基因全部编码区的所有变异,分析中国汉族PD患者组和正常对照组之间这些变异的基因频率和等位基因频率分布是否有差异,确定FBXO42与中国汉族PD发病的相关性。方法:首先对151例PD患者的FBXO42基因全部编码区及部分非编码区用聚合酶链式反应-单链构象多态性(Polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism, PCR-SSCP)结合测序的方法进行筛查并确定变异类型。然后用统计学方法分析已发现变异的基因频率与等位基因频率在316例PD患者(包括之前的151例)及295例与患者匹配(按性别,年龄及地域进行匹配)的正常对照组间的分布差异,并对发现的多个变异进行单体型分析。结果:1.对FBXO42基因检测发现患者组和对照组存在三个变异(rs2273311,rs12069239和rs35196193),此外,在一名散发PD患者中发现一个新的T>C碱基替换c.1407T>C。在线预测发现四个变异均不改变剪接位点。2.统计分析发现三个变异(rs2273311, rs12069239和rs35196193)的基因频率及等位基因频率在316例PD患者和295例正常对照之间的分布无统计学差异。3.单倍体分析发现FBXO42基因的个常见单体型G-C-G (rs2273311-rs12069239-rs35196193)与中国汉族PD的发病相关(P=0.002, OR=1.69,95%CI=1.06-2.71),进行Bonferroni校正后仍有统计学意义(P=0.008)。结论:虽然FBXO42基因的编码区变异可能与中国汉族PD发病无关,但FBXO42基因的单体型(G-C-G)可能使PD的发病风险增高。
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