藜麦谷氨酸脱羧酶(GAD)基因多态性分析及拟南芥矮小突变体的基因定位

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γ-氨基丁酸(γ-aminobutyric acid,简称GABA)是一种四碳非蛋白质氨基酸,普遍分布于真核生物和原核生物中,具有重要的生物学功能。在哺乳动物中,GABA作为重要的抑制性神经递质调节神经元的兴奋性。在植物中,GABA不仅是一种次生代谢物,还是一种信号分子。GABA在植物体应答逆境胁迫、生长发育、调节碳氮营养平衡等方面具有重要作用。谷氨酸脱羧酶(Glutamate decarboxylase,简称GAD)是5’-磷酸吡哆醛(5’-Pyridoxal phosphate,简称PLP)依赖的胞质酶,不可逆催化L-谷氨酸氧化脱羧合成GABA,是合成GABA的关键限速酶。GAD的活性与GABA的含量密切相关。由于功能基因多态性对于次生产物的代谢非常重要,所以我们对GABA合成的关键酶GAD基因在藜麦中的多态性进行分析,探究其与GABA含量的相关性。首先分析了藜麦基因组序列,发现藜麦基因组中有8个GAD基因,然后设计了相应的引物,并对同一栽培条件下的796个藜麦品种中的AUR62038577基因进行了多态性的分析,根据PCR产物带型对各藜麦品种进行了初步分类;然后从具有相同带型的品种中分别挑选两个品种,利用全自动氨基酸分析仪测定其GABA含量;最后分别挑选了GABA含量最高和含量最低的两个品种,利用RT-PCR法克隆了其Cq GAD的c DNA序列,分析了AUR62038577基因的序列多态性位点与GABA含量之间的相关性。另外,对实验室已有的一个拟南芥矮小突变体进行了初步表型分析,通过三次回交纯化了该突变体。因为这个突变体中的T-DNA已经丢失,所以利用图位克隆技术将该突变体的对应突变基因定位于拟南芥2号染色体上18.42Mbp与18.79Mbp之间。然后通过基因组重测序获得了一些In Del和SV位点,目前正在一一验证中。
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