云南省是水资源短缺的地区，农业是用水大户。由于云南省地处高原山区，降水少量低，雨季和旱季分明。地表水分布较少，地形地貌复杂多样，特别是卡斯特地貌和溶洞不利于储存地表水。因此保障云南省农村生活用水和农业用水，必须要加强农村水利基础设施的投入和建设。农业生产直接关系到农民生活水平的高低，而农业生产离不开水利设施，所以建设农村水利基础设施是建设农村基础设施的重中之重，不仅如此，建设完善的农村水利设施有利于保护农村良好的生态环境。在云南省，农村的水利基础设施建设在各级政府的支持下，已经了很大的改善，但是一些问题仍然有待处理，比例工程设计不当造成农村水利基础设施不能满足农民需要，资源配置不优化，导致土地等公共资源的浪费，最终影响了农村经济的进一步发展。究其原因主要是融资主体和融资渠道存在缺陷而导致的。本文关于农村水利基础设施建设项目的建设融资方面对云南具有代表性的楚雄和西双版纳两个地州进行了考察分析，发现了两个存在的问题，即建设融资主体和融资渠道，并对这两个问题的成因做了深入分析，同时将国外的成功经验与云南省农村地域特点相结合，提出了更加完善的融资方法，包括政府优惠政策，专项贷款、筹建建设基金等；税收政策，包括征税受益者、税收优惠；对信贷利率进行适当补贴，以及来自社会的帮助，包括组织或个人名义的捐赠；金融支持体系等。并且提出了开发公共财政的更好的更新的职能，根据云南省各农村的特点使用符合当地发展方式的融资方案，同时发展农村新经济体系以期对云南省农村公共基础设施建设，特别是农村水利的建设提供一定的借鉴意义。