酿酒酵母菌株的遗传多样性分析

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酿酒酵母是葡萄酒酿造过程中最主要的微生物,研究其多样性有助于酵母菌资源的开发和利用,有利于优良酿酒酵母菌种选育,对研究其表型差异的遗传基础和解释物种进化史意义重大。本研究采用4个微卫星标记(ScAAT1、YOR267c、C11、YPL009c)对来自UCD菌种保藏库的酵母菌、商业酵母以及来自陕西泾阳的酿酒酵母共176株酵母菌的遗传多样性进行了分析,毛细管电泳检测PCR扩增产物的片段大小,用PopGen32软件进行遗传参数的分析,用NTsys软件构建基于每对菌株的Jaccard相似性系数的非加权算术平均数(UPGMA)聚类图,探讨了酵母群体之间的关系。结果表明:1.53株来自UCD菌种保藏库的酵母菌4个微卫星位点分型表现出51种基因型,4个位点检测到的等位基因数目为17-23个不等;46株商业酵母4个微卫星位点分型表现出43种基因型,4个位点检测到的等位基因数目为20-24个不等;77株陕西地区酿酒酵母4个微卫星位点分型表现出38种基因型,4个位点检测到的等位基因数目.为8-13个不等。2.176株酵母菌4个微卫星位点共检测到了 145个等位基因,平均每个位点检测到36.25个等位基因,观测杂合度在0.4375~0.6743之间,多态信息含量在0.8690~0.9227之间,均为高度多态(PIC>0.5),很好地反映了酵母丰富的遗传多样性。3.四个微卫星位点在三个群体中等位基因多样性的表现情况基本相似。ScAAT1在三个群体中均表现出最高的等位基因多样性;YPL009c在三个群体中均表现出最低的等位基因多样性。YOR267c在三个群体中均表现出最大等位基因与最小等位基因之间差异最显著。三个群体在每个位点都有其群体特有的等位基因。4.三个群体ScAAT1和YOR267c两个位点的等位基因不呈现集中分布,每个群体等位基因片段均匀分布在所有等位基因中,无明显差异。C11位点,商业酵母和陕西地区酵母等位基因基本分布在片段较小区,UCD酵母菌等位基因基本分布在片段较大区;YPL009c位点与C11位点相反,商业酵母和陕西地区酵母等位基因基本分布在片段较大区,UCD酵母等位基因基本分布在片段较小区。计算了群体间Nei氏遗传距离,商业酵母与陕西地区酵母遗传距离最近,UCD酵母与陕西地区酵母遗传距离最远。5.对我国西北地区包括新疆、宁夏,陕西三地的酿酒酵母的群体遗传分析表明,新疆地区与宁夏地区的酿酒酵母群体遗传距离较近,新疆地区与陕西地区的酿酒酵母群体遗传距离较远,C11位点三个群体的等位基因分布有显著不同,我国的菌株与国外菌株相比表现出差异。
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