线蛱蝶亚科（Limenitinae）隶属于鳞翅目（Lepidoptera）蛱蝶科（Nymphalidae），是蛱蝶科中较大的亚科之一。该亚科蝶类多数为中型或大型种类，主要分布在中北美洲、东洋区和古北区。全世界共有46属800余种，其中，中国有的22个属共118个种，约占世界总数的1／8，主要分布于我国南方。迄今，国内外主要是基于传统的形态学性状对该亚科的系统分类学研究，而相关的分子系统学研究还非常匮乏。本文尝试以线粒体细胞色素氧化酶I（COI）及细胞色素b（Cytb）基因为分子标记，对线蛱蝶亚科的18种蝴蝶的COI基因的部分序列（约650bp）以及25种蝴蝶的Cytb基因序列（约430bp）进行了 PCR扩增和序列测定，分析了这2个基因序列片段的组成成分、替换饱和性等序列特征，并以MEGA、PAUP等系统发生分析软件采用邻接法（NJ）、最大简约法（MP）及贝叶斯法（BI）重建了该亚科主要类群的系统发生树，探讨了它们之间的系统发生关系。　　通过对结果的分析讨论，得出以下结论：　　1.对线蛱蝶亚科蝴蝶线粒体COI基因及Cytb基因具有昆虫线粒体所具有的高A＋T含量，分别为69.6％与74.4％，碱基组成出现AT偏斜。　　2.线蛱蝶亚科COI基因及Cytb基因中核苷酸的替代转换高于颠换，Cytb基因第三位点在各分类单元间存在碱基组成偏向性。　　3.关于线蛱蝶亚科是否可以成为一个独立亚科，综合形态学及最新的分子证据，笔者认为Harvey（1991）分类体系中的线蛱蝶族应该脱离出来以一个独立的亚科而存在，即线蛱蝶亚科。　　4.基于Cytb基因的线蛱蝶亚科系统发育分析结果表明，所有线蛱蝶亚科聚为两大枝：第一枝包括环蛱蝶属、菲蛱蝶属、蟠蛱蝶属和缕蛱蝶属；第二枝包括丽蛱蝶属、穆蛱蝶属、线蛱蝶属、带蛱蝶属、律蛱蝶属和翠蛱蝶属；其中线蛱蝶属非单系群，翠蛱蝶属和律蛱蝶属则为单系发生，并构成姐妹群；缕蛱蝶属与环蛱蝶族亲缘关系较近。对于穆蛱蝶属、菲蛱蝶属和蟠蛱蝶属，本研究没有完全解决它们与所在支系内其它属间的亲缘关系。　　本研究对COI及Cytb基因在线蛱蝶亚科蝶类中的分子进化特性与系统发育研究方面的应用进行了初步研究，为探讨中国线蛱蝶亚科的分子进化规律，重建该亚科的系统发育关系提供分子生物学方面的证据，从而有助于建立更为完善和科学的蛱蝶科分类体系。