党的十八届五中全会提出“创新、协调、绿色、开放、共享”的五大发展理念,把绿色发展提升至国家战略层面,党的十九大报告提出“形成绿色发展方式和生活方式,坚定走生产发展、生活富裕、生态良好的文明发展道路,建设美丽中国”。新疆是我国西北重要的生态屏障,生态环境具有多样性、复杂性、脆弱性的特征,节能减排、大气污染防治任务繁重,经济增长和能源消耗对生态环境的压力依然较大。与此同时,中国近年来的发展面临着经济下行的压力,新疆GDP增速也由2012年的12%连续六年下滑到2018年的6.1%,低于全国平均水平6.6%。在这样的背景下,新疆亟需找到一种方法既能践行美丽中国的美好愿景,又能促进本地经济的增长。那么,将绿色化融入到发展中,实现绿色经济发展与产业结构升级的“互为支撑,彼此促进”,对于促进经济增长,保护我国西北地区生态屏障和建设绿色丝绸之路具有重要的战略意义。基于上述问题,本文首先从绿色经济发展与产业结构升级协调性的研究视角出发,参考国内外学者的相关研究并结合基础理论,阐述绿色经济发展与产业结构升级的作用机理;其次,建立包含经济社会、生活质量、资源资产、环境质量四个方面在内的绿色经济发展综合评价体系以及包含合理化、高度化、效益化、生态化四个方面在内的产业结构升级综合评价体系,并利用熵权赋值法,对2005-2017年新疆及其十四个地州市（不含兵团城市）绿色经济发展与产业结构升级进行综合评价;再次,构建系统耦合评价模型,定量评价了新疆及各地州市绿色经济发展与产业结构升级的耦合协调度;最后,基于灰色关联系统理论,利用灰色关联度评价模型,测算新疆各地州市绿色经济发展系统与产业结构升级系统间各相关因素关联度,并分析各因素对系统的相对影响程度。研究表明:（1）新疆及各地州市绿色经济发展与产业结构升级二者之间具有双向反馈的作用机制,均处于绿色经济发展与产业结构升级高水平耦合阶段,二者之间相互作用强,能互为支撑。（2）新疆整体绿色经济发展与产业结构升级综合发展水平基本处于同步型发展,而各地州市二者大多处于非同步型发展阶段。（3）新疆整体绿色经济发展与产业结构升级协调发展水平处于高级协调等级,而各地州市大多处于初级协调阶段,协调发展水平动态变化趋势基本保持一致,在空间上呈现“由北向南逐渐递减”的变化。（4）新疆各地州市绿色经济发展与产业结构升级之间有正向的推动作用,且两系统之间各相关因素对系统的影响程度不同,所以要因地制宜制定二者协调并进的发展战略。