FXR1P相互作用RNA的文库筛选

来源 :南华大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:shenyemaizui
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目的及意义:脆性X综合征(Fragile X syndrome, FXS)是最常见的遗传性智力低下疾病之一,脆性X综合征是由其致病基因 FMR1(脆性 X 智力低下基因1)的突变导致。FXR1(Fragile X related gene 1,脆性X相关基因1)与 FMR1 属于同一个基因家族,是一种对于神经、肌肉系统发育有重要调控作用的管家基因,其编码产物FXR1P具有RNA结合功能,但是目前对其结合的靶 RNA 了解十分有限,本研究利用酵母三杂交系统从人脑海马回cDNA文库中筛选FXR1P的靶RNA,以进一步阐明FXR1基因的功能。 内容和方法:1)构建用于酵母三杂交的人脑海马回 pRH3 cDNA 文库;2)将重组质粒 pYESTrp3/ FXR1 作为“诱饵”质粒,转染酵母菌 L40-ura3/ pHybLex/ Zeo-MS2,并检测毒性和自激活性;3) 应用酵母三杂交系统,从人脑海马回 cDNA 文库中筛选 FXR1P 的相互作用 RNA,得到 His+ 和 LacZ+ 阳性克隆,并通过酶切鉴定其外源性片段;4)将获得的阳性质粒与诱饵质粒一对一重新转入酵母菌内,对 RNA-蛋白质作用进行验证;5)对验证后的阳性克隆的外源性片段进行测序及同源性分析。 结果:1)成功构建了能用于酵母三杂交的人脑海马回 pRH3 cDNA 文库;2)将 pYESTrp3/ FXR1 质粒转化酵母菌 L40-ura3/ pHybLex/ Zeo-MS2,并通过检测证实其对酵母细胞无毒性、无自激活性;3)以 pYESTrp3/ FXR1作为“诱饵”,从胎脑cDNA文库中筛选得到 56 个 His+ 和 LacZ+ 阳性克隆;4)将初步获得的阳性质粒与诱饵质粒一对一重新转入酵母体内,对相互作用进行验证,共获得阳性克隆 9 个;5)对阳性克隆测序并进行同源性分析,获得阅读框正确的候选基因序列 4 个:Homo sapiens tubulin, alpha, ubiquitous (K-ALPHA-1)、Homo sapiens IQ motif containing E (IQCE)、Homo sapiens dipeptidyl-peptidase 7(DPP7)、Homo sapiens leukocyte receptor cluster(LRC)member 4,(LENG4)。 结论及意义:1)建立了应用酵母三杂交系统进行RNA-蛋白质相互作用的研究平台;2)成功构建人脑海马回 pRH3 cDNA 文库;3)筛选并鉴定出 4 个不同的基因,其编码的 RNA 可能与 FXR1P 具有相互作用,为 FXR1P 的功能提供了新的实验数据。
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