晚期胃癌患者危重病人预警蛋白质(LGT)指纹不同表达时伴随指纹的分析

来源 :山西医科大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:wayl1s1s
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目的:分析晚期胃癌患者危重病人预警蛋白质(LGT)指纹不同表达及演变状态下,其伴随指纹的分布特点,构建其指纹库。方法:研究采用SELDI、CM10蛋白质芯片技术,以晚期胃癌患者血清中出现质核比(M/Z):11000+H~12000+H的蛋白质指纹,设定为LGT阳性指纹。选取入院接受手术的81例晚期胃癌患者,并进行1年的随访,用SELDI、CM10蛋白质芯片技术对这些患者随访前后各进行一次检测,根据两次检测LGT指纹表达的情况分组,其中,A组:LGT指纹由阴性向阳性演变组(25人)、B组:LGT指纹由阳性向阴性演变组(15人)、C组:LGT指纹持续阴性组(29人)、D组:LGT指纹持续阳性组(12人)。另选自愿抽血的肿瘤患者17例,其中,1组:同一患者一份血样分成两份,间隔一周行SELDI检测(12人),2组:同一患者连续两天抽血送检(5人)。以此作为SELDI检测系统重复性和稳定性的对照组。采用Biomarker Wizard 3.1、Biomarker Pattern软件筛选不同分组胃癌患者的差异指纹,建立相应的决策树模型。结果:1.作为对照组,1组共检测了1223个蛋白质组指纹,其中有39个指纹差异有统计学意义(p<0.05),M/Z:1058、1085、1086、1094、1008、1122、1011、1007、1030、1004、1005、1015、1017、1026、1028、1031、1033、1042、1055、1056、1057、1066、1068、1069、1070、1072、1073、1123、1141、1144、1167、1029、1055、1098、1099、1100、1101、1102、1103和1109。2组共检测了468个蛋白质组指纹,其中有18个指纹差异有统计学意义(p<0.05),M/Z:753、1056、1058、1085、1008、1030、731、752、1007、1017、1042、1057、1081、1083、1099、1100和1124。差异指纹中M/Z:1007、1008、1017、1030、1042、1056、1057、1058、1085和1099在两种取样状态下均存在,呈双表达。结果认为,两种采样方法出现共同差异蛋白质指纹,说明系统的不稳定性,而其余单表达出现的差异蛋白质说明在采样过程中出现不稳定性。两者都表明,完全重复性是不存在的。2.作为分析组,A组有6个蛋白质指纹差异有统计学意义(P < 0. 05),与对照组相比无相同指纹,不需剔除。其中上调的指纹M/Z:11473、11821、11664、11409、11552和11947,无下调的指纹。B组有14个蛋白质指纹差异有统计学意义(P < 0. 05),与对照组比较,M/Z: 1098、1029和1007的指纹与之相同,剔除后,剩余了11个有统计学意义的差异蛋白质指纹,其中上调的指纹M/Z:878、861、874、917和3264。下调的指纹M/Z:6523、11509、11669、11413、11351和6483。C组有1个蛋白质指纹差异有统计学意义(P < 0. 05),对照组中差异指纹M/Z:1029指纹与之相同,予以剔除后,剩余了0个有统计学意义的差异蛋白质指纹。D组有0个蛋白质指纹差异有统计学意义(P < 0. 05)。结论:1.对照组中M/Z:1007、1008、1017、1030、1042、1056、1057、1058、1085、1098、1099、731、752、753、1004、1005、1011、1015、1023、1026、1029、1031、1033、1041、1042、1044、1055、1066、1067、1068、1069、1070、1072、1073、1081、1083、1086、1094、1101、1102、1103、1109、1122和1124蛋白质指纹为影响因素,需要予以剔除。2.SELDI、CM10蛋白质芯片技术检测晚期胃癌患者血清捕获的M/Z:11473、11821、11664、11409、11552和11947蛋白质指纹上调,可视为晚期胃癌患者LGT指纹由阴性向阳性演变时LGT蛋白质指纹亚型;M/Z:11509、11669、11413、11351蛋白质指纹下调可视为胃癌患者LGT指纹由阳性向阴性演变时LGT蛋白质指纹亚型;M/Z:878、861、874、917和3264蛋白质指纹上调,M/Z:6523、和6483蛋白质指纹下调,可视为胃癌患者LGT指纹由阳性向阴性演变时伴随的相关蛋白质组指纹;而当晚期胃癌患者LGT指纹持续阴性或者持续阳性时无相关的差异蛋白质指纹。
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