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本研究通过形态标记和分子标记(AFLP、SSR和RAPD)的方法,对来自湖南及其它地区甘薯品种的遗传多样性进行了系统分析,使用的品种共计61份,其中育成品种29份,地方品种32份。育成品种包括16份国内品种,其中湖南品种11份,江苏品种3份,四川品种2份；13份国外品种包括巴西品种1份,菲律宾品种2份,马来西亚品种1份,马里品种1份,美国品种4份,尼日利亚品种1份,日本品种3份。地方品种包括32份国内品种,其中湖南品种20份,广东品种6份,福建品种2份,海南品种2份,湖北品种1份,重庆品种1份。获得的结果如下：1.用区分甘薯品种的基本形态特征：株型、叶型、叶色、叶脉色、脉基色和茎蔓色,可以将61份甘薯品种初步区分丌,表明供试材料中育成品种和地方品种具有较丰富的形态变异,而湖南甘薯育成品种和地方品种之间遗传差异较大。2.用12对AFLP引物、12对SSR引物和20个RAPD引物对61份甘薯品种进行扩增,分别扩增出324条、110条和153条多态性带,平均每条(对)引物扩增出27条、9条和7.6条多态性带,可将61份甘薯品种完全区分开。AFLP在揭示多态性水平和实验的稳定性高于SSR和RAPD,表明AFLP可以作为甘薯遗传多样性分析的首选标记。3.利用AFLP、SSR和RAPD三种分子标记结果对供试材料进行UPGMA聚类分析,可以将61份供试材料分为六个组群。以第工组群和第Ⅲ组群包括品种最多：第工组群,共38份品种,其中地方品种20份,育成品种共18份；第Ⅲ组群,共17份品种,其中地方品种10份,育成品种7份；除湖南地方品种涟73-21-3和祁阳黄心薯聚为第Ⅱ工组群外,其余皆聚为第Ⅰ和第Ⅲ组群；尼日利亚育成品种TiB10和马来西亚育成品种暹罗红分别单独聚为第Ⅳ和第Ⅴ组群；第Ⅵ组群为美国育成品种百年纪念和巴西育成品种西蒙1号。4.根据三种分子标记遗传距离的计算,湖南育成品种与地方品种遗传距离分别为：0.3778-1.0000、0.2308-1.0000和0.0588-0.6842,平均遗传距离分别为0.7278、0.5443和0.2793,表明湖南甘薯品种遗传变异幅度较大。湖南地方品种间平均遗传距离分别为0.6537、0.5362和0.2955；湖南育成品种间平均遗传距离分别为0.7075、0.4583和0.295 1。通过湖南地方品种与育成品种的遗传距离比较,AFLP标记结果为地方品种遗传距离小于育成品种,SSR标记与RAPD标记结果地方品种遗传距离大于育成品种,即GDLAFLP<GDMCAFLP,GDLSSR>GDMCSSR,GDLRAPD>GDMCFAPD。5.综合三种分子标记,得出湖南甘薯育成品种与地方品种的遗传距离为0.294 1-0.8644,平均0.5038；对不同地区地方品种及育成品种的平均遗传距离进行比较分析,地方品种湖南与广东的平均遗传距离最远,育成品种湖南与马来西亚平均遗传距离最远,因此,在今后湖南甘薯亲本选配上应重点考虑这些地区的品种。