天蓝色链霉菌膜蛋白复合物及部分脂蛋白功能的研究

来源 :上海交通大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:smlz
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
细胞膜是原核生物细胞的重要组成结构,其功能主要涉及能量转换、物质运输以及信息识别与传递等。了解细胞膜的功能与机制,特别是物质的跨膜运输,具有重要的实践意义。我们分别采用BNE、hrCNE等一维电泳、以及native/native、native/SDS-PAGE等二维电泳方法对天蓝色链霉菌的膜蛋白质组进行了分析研究。核酸干扰是影响native电泳的主要因素,为了除去膜组分中核酸成分,在加入DDM抽提膜蛋白之后,我们采用了多种方法去除核酸,结果表明,超速离心是一种有效地去除核酸方法,native电泳性能有了明显提高。我们对BNE、hrCNE-DDM和hrCNE-Triton等三种电泳的最佳上样量进行了比较研究;结果表明,三种电泳的最适上样量均为80-100μg。通过二级质谱分析,我们鉴定了77个蛋白质;其中,61个蛋白质来自hrCNE-Triton/SDS-PAGE二维凝胶,48个蛋白质来自hrCNE-DDM/SDS-PAGE二维凝胶,其余来自hrCNE/hrCNE二维凝胶。根据这些蛋白质的生理功能以及聚合状态,我们对这些蛋白质进行了分类,其中,20个蛋白质分别归属于15个蛋白复合物,包括完整的ATP合酶,细胞色素aa3氧化酶核心酶,Tri1六聚体,GlnA同聚体以及BFR同聚体等。另外,我们鉴定了多个与跨膜运输相关的蛋白,包括BldKB(SCO5113)、OBP(SCO5477)以及ABP(SCO2008)等;BldKB和OBP与寡肽的运输有关,而ABP与氨基酸的运输有关。OBP和BldKB是膜组分中含量最丰富的两个蛋白质,它们是OppA家族的成员,而OppA家族在胞外多肽降解、信号传导等方面具有重要作用。BldKB可能存在三种聚合状态,分别是单体,二聚体以及四聚体;OBP也可能存在三种聚合状态,分别是单体,二聚体以及四聚体;这种多聚体状态很可能是它们转运胞外复杂多肽的一种适应方式。天蓝色链霉菌编码223个脂蛋白,其中40%脂蛋白是溶质结合蛋白,它们与碳水化合物、氨基酸、多肽、核苷以及铁离子运输等密切相关,我们发现并鉴定17个溶质结合蛋白。脂蛋白SCO4884和SCO4885具有PBP1_Bmp A_PnrA_like保守区域,可能与核苷运输有关。我们首先在大肠杆菌BL21中过量表达了脂蛋白SCO4884和SCO4885;根据hrCNE电泳、分子筛以及粒度测定结果,我们确认SCO4884和SCO4885在溶液中均以单体存在。利用等温滴定量热法,我们发现SCO4884、SCO4885与腺苷、脱氧腺苷、胞苷、脱氧胞苷以及尿苷等具有亲和特性,而与鸟苷、脱氧鸟苷以及胸苷等不具有亲和特性。放线紫红素是一种II型聚酮化合物,其碳链合成由聚酮合酶核心酶(PKS)催化。已有研究表明,参与II型聚酮化合物合成的各个酶之间存在相互作用,而且这些酶类可能分布在细胞的不同部位,比如,SCO5074存在于细胞壁,SCO5076、SCO5083以及SCO5084存在于细胞膜,而核心酶SCO5087和SCO5088可能也存在于细胞膜,组成ActKSαβ膜复合物。利用载体pSJ7,我们对聚酮合酶核心酶(SCO5087、SCO5088、SCO5089)以及后修饰酶(SCO5086、SCO5090)进行了克隆表达研究,纯化以后并制备抗体,这些抗体的应用为探索基因簇中各基因的功能、蛋白质相互作用以及聚酮合酶的细胞定位提供了检测手段。
其他文献
目的:医师职业精神一直以来都是提高医疗质量的基石,它的核心原则是将患者利益放在首位,始终在个人利益和金钱之前,不断提升自身专业知识和能力,以提高和确保医疗质量,同时促
收费公路政策的变化必然对高速公路企业带来重大经济影响,包括经济效益提升、债务规模和财务风险降低、新建审批严格、竞争加剧、经营管理难度增加等方面。高速公路企业必须
粘体动物是一类个体微小、具包囊结构的后生动物,广泛寄生于水生脊椎和无脊椎动物。目前,已报道的粘体动物种类达2500余种,大多数种类对宿主不造成危害,少部分物种能引发疾病
颅内动脉瘤破裂出血是严重威胁人类生命的疾病,出血死亡率约50%(包括入院前死亡),而幸存者中约1/3不能生活自理,且有再次出血的可能.尽管神经影像学、显微神经外科及血管内治
感染、休克、心脏大手术以及肾移植过程中肾脏均会遭遇缺血再灌注(ischemia/reperfusion,IR)的情况,造成急性肾脏损伤(acute kidney injury,AKI)。而部分AKI患者会进展为慢性
肝细胞具有独特的极性结构,其中两个相邻细胞形成胆汁腔面(即顶端膜),其余区域为窦状间隙面(即基底侧膜)。肝细胞极性的建立和维持对于正常细胞的生理功能和肝组织稳态至关重
二氧化硫脲是一种有效、安全的新型还原剂,综述了由分光光度法和电势法研究得出的二氧化硫脲碱性水溶液的性质、二氧化硫脲的结构和不同条件下其溶液的性质变化。还综述了二
《国语》全篇以记言为主,记事为辅,在这些记言类文章中以论说文较多。本研究主要采用文本分析法和文献法,以《国语》中的论说文为研究对象,结合前人对类似文体的研究方法和研
以聚乙二醇为改性剂,研究在溶剂条件下降低煤沥青中3,4-苯并芘的工艺。研究表明,当混合溶剂V环己烷∶V甲苯=2∶1为反应溶剂、硫酸用量为煤沥青质量的6.67%、聚乙二醇600用量
最短路径问题为图论中的一个经典问题,其算法的研究在优化问题中有着重要的理论价值,很多现实优化问题都可以转化为最短路径问题来进行求解。随着科学技术的飞速发展和日常生活的需要,传统的最短路径问题无法满足人们的需求,由此衍生出了带有各类资源约束的最短路径问题,本文中所研究的问题模型就是其中的一种,为带有时间窗和容量资源约束的基本最短路径问题(ESPPRC)。本文针对带有资源约束的基本最短路径问题的精确算