基于一般家庭结构的Haseman-Elston方法推广

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基因位点连锁研究是近代群体遗传学中的一个重点研究内容。经典的Haseman-Elston回归分析方法在对定量性状进行连锁分析时具有良好的表现,使得其在具有复杂性状疾病的家庭谱系基因连锁分析研究中被频繁运用。目前大部分有关Haseman-Elston方法的研究都是基于同胞对设计,很少有推广到远亲亲属对。但连锁研究通常不应局限于同胞对设计,就我国而言,九零后一代基本是独生子女家庭,因此用基于兄弟对的Hasema-Elston方法来做连锁研究在数据收集及分析方面无疑是困难的,如果能找到针对一般亲属对的回归方法,将对基因连锁分析未来的发展起到很大的推动作用。通过梳理连锁分析有关的文献发现鲜少有深入研究讨论一般亲属对设计的方法,该类亲属对设计有待进一步研究。本文对基于兄弟对设计的Haseman-Elston方法以及基于兄弟对设计的均值校正交叉积Haseman-Elston方法进行了拓展延伸。首先对基于兄弟对设计的Haseman-Elston方法、基于兄弟对设计的均值校正交叉积Haseman-Elston方法,以及基于祖孙对设计的Haseman-Elston方法进行理论阐述,接下来对本文提出的基于祖孙对设计的均值校正交叉积Haseman-Elston方法进行理论推导,并对四种方法在不同的重组率和遗传力下的功效进行对比。结果表明,在重组率大于0.2时,基于祖孙对设计的均值校正交叉积Haseman-Elston方法的功效优于其他三种方法,并且该方法的检验功效较稳健。本文所提出的基于祖孙对设计的均值校正交叉积Haseman-Elston方法既能尽可能多的包含连锁信息,又能在一定的条件下比基于兄弟对设计的均值校正交叉积Haseman-Elston方法,以及基于祖孙对设计的Haseman-Elston方法的检验功效更高。
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