基于网络分析的肾结石关键基因和信号通路的鉴定及其分子机制研究

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本文使用生物信息学组学整合方法以及细胞分子生物学方法对肾结石形成与发展的分子机制进行研究。首先,使用蛋白质相互作用网络分析方法,分析肾结石相关蛋白质组学研究数据,预测发现肾结石相关核心蛋白富集于与内质网应激及内质网应激相关的降解等生物学事件上。细胞分子生物学实验证明,草酸钙刺激肾小管上皮细胞以及大鼠肾结石模型,大鼠肾脏组织通过三条通路(包括PERK,IRE1和ATF6)发生了内质网应激,并且使用内质网应激诱导剂和抑制剂证明了内质网应激影响细胞凋亡以及结晶——细胞黏着。然后,肾结石相关基因组及转录组数据整合分析中进一步发现,细胞窖蛋白1(Caveolin-1,CAV1)和表皮细胞生长因子(Epidermal Growth Factor,EGFR)是两个肾结石相关核心蛋白,而细胞黏着斑信号通路(Focal adhesion)为关键的细胞信号转导通路。实验证明草酸钙刺激肾小管上皮细胞及肾结石动物模型中,细胞及大鼠动物组织CAV1,EGFR,AKT蛋白表达下调,m RNA水平不变。过表达CAV1后草酸钙刺激导致的细胞凋亡和细胞表面钙离子黏着水平增加的情况被逆转。添加蛋白酶体抑制剂后草酸钙下调CAV1及EGFR蛋白的情况被逆转,暗示这两个核心蛋白在草酸钙刺激下可能通过内质网应激相关的泛素——蛋白酶体途径降解。综上,本论文首次发现,肾脏草酸钙结晶诱导内质网应激并通过翻译后调控影响CAV1-EGFR-AKT黏着斑信号通路,进而导致细胞凋亡和结晶——细胞相互作用增强。该研究为肾脏中结晶——细胞相互作用的分子机制提供了崭新的解释,为肾结石防治新靶点的研发提供了参考。
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