目的:分析卵巢子宫内膜异位囊肿、卵巢单纯囊肿囊壁组织及正常卵巢组织差异表达蛋白,筛选出与卵巢子宫内膜异位囊肿复发密切相关的差异蛋白作为标志物,并探讨其临床价值。方法:收集经海南省人民医院妇科手术的卵巢子宫内膜异位囊肿的囊壁组织、卵巢良性囊肿囊壁组织及正常卵巢组织各6例,采用同位素标记的相对和绝对定量(iTRAQ)技术筛选不同组间的差异表达蛋白,结合功能注释及生物信息分析,筛选出与卵巢子宫内膜异位囊肿复发相关的差异表达蛋白,采用免疫组化法对筛选出的复发相关差异表达蛋白进行验证。结果:共鉴定出三组共同上调的蛋白有359个;与正常卵巢组和卵巢单纯囊肿组相比,变化倍数均在2倍以上且在卵巢子宫内膜异位囊肿组高表达的蛋白27个,其中显著表达上调前五位蛋白为CLC、DEFA1、S100A9、S100A8、FTL;免疫组化验证结果显示差异蛋白S100A9及S100A8变化趋势与iTRAQ检测结果相符,CLC、DEFA1、FTL未发现类似变化趋势;S100A9及S100A8蛋白在卵巢子宫内膜异位囊肿复发组中高表达阳性率高于未复发组;发现了1种新的在卵巢子宫内膜异位囊肿中显著高表达的功能未明蛋白A8K3Q9。结论:卵巢子宫内膜异位囊肿存在高表达的差异表达蛋白;筛选出的差异蛋白S100A9及S100A8有可能成为预示卵巢子宫内膜异位囊肿术后复发及指导后续治疗的分子标志物。