杨树NF-Y转录因子家族的全基因组鉴定及表达分析

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核因子Y(Nuclear factor Y,NF-Y),又称CCAAT结合因子(CCAAT-binding factor,CBF)或亚铁血红素激活蛋白(Heme activator protein,HAP),是一类普遍存在于酵母、动物、植物等真核生物中的转录因子,通常由三种不同亚基组成,即NF-YA(CBF-B或HAP2)、NF-YB(CBF-A或HAP3)和NF-YC(CBF-C或HAP5),并且NF-YA、NF-YB和NF-YC能形成异源三聚体复合物,并与其它调控因子相互作用,调控下游基因的表达。近来对NF-Y功能的研究主要集中在拟南芥、水稻和大豆中。在本文中运用的生物信息学方法,在杨树全基因组中鉴定NF-Y转录因子,获得杨树NF-Y家族信息。并且选取受干旱胁迫诱导的NF-Y家族基因PtNF-YA3/-4,通过对其胁迫诱导表达模式分析、亚细胞定位、转录活性去验证基因的分子特征,并对获得的转基因拟南芥进行初步的功能分析。本文主要结果如下:1.在杨树中鉴定了52个NF-Y家族基因,包括13个NF-YA,20个NF-YB和19个NF-YC,并进一步分析了不同亚家族成员的序列特征。2.生物信息学分析发现NF-YA亚家族具有更加相似的基因结构特征,除了PtNF-YA11外,其它的NF-YA亚家族基因的基序都更加保守。3.胁迫诱导表达模式分析表明13个NF-YA基因都不同程度的受到干旱、盐和冷等不同的胁迫诱导表达。其中PtNF-YA4在PEG处理6 h后,基因的表达水平是正常条件下的140多倍,而PtNF-YA3则是在PEG、ABA、Salt和Cold四种处理下都被抑制表达。4.亚细胞定位结果显示,在正常条件下PtNF-YA3定位在细胞核和细胞膜上,PtNF-YA4定位在细胞核上,而在PEG、Salt和Cold处理下,PtNF-YA3/-4都定位在细胞核上。转录活性结果表明PtNF-YA3/-4都不具有自转录激活活性。5.对获得的过表达PtNF-YA3转基因拟南芥,在300 mM甘露醇处理下,发现转基因拟南芥幼苗的根长明显大于野生型;此外转基因拟南芥叶片表型有变化,转基因拟南芥的叶片狭长且卷曲。
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