结核分枝杆菌耐药表型与基因型相关性及一种新的突变筛查方法的建立

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本论文主要包括两部分内容。第一部分对结核分枝杆菌耐药表型与基因型的相关性进行了探讨,包括了五种一线抗结核药物(异烟肼,利福平,乙胺丁醇,链霉素,吡嗪酰胺)和四种二线抗结核药物(氧氟沙星,卡那霉素,阿米卡星和卷曲霉素)。第二部分首次提出了一种高分辨熔解结合非标记探针熔解分析进行长片段突变筛查的方法,并将该方法应用于结核分枝杆菌吡嗪酰胺耐药突变的筛查。   第一部分:漫长的诊断时间严重妨碍了结核病防控工作的展开,尤其影响了耐药结核病人和HIV共感染结核病人化疗方案的快速制定和实施。病人耐药情况的快速检测有利于降低致死率,阻断病原传播过程。目前的常规药敏试验方法耗时,耗力,难以在基层医疗卫生单位普及。分子诊断的方法具有快速,准确,灵敏度高,价格低廉等优点,有望解决目前结核分枝杆菌耐药检测所面临的困境。结核分枝杆菌耐药主要由相关基因突变引起。在本研究中我们通过对比178份临床菌株的药敏试验结果和基因突变情况,研究耐药表型与基因型的相关性,试图发现具有临床诊断意义的位点。同时我们还对两种世界卫生组织推荐的比例法药敏试验进行了比较。相比于L-J培养基,BECTECTM MGITTM960系统可以在更短时间内提供同样准确、灵敏的结果,但同时需要高额的支出,并伴随较高污染率的发生。我们发现了不同药物耐药相关的突变位点,这些位点可以用来做药物耐药性的分子标记。我们得出结论:虽然分子诊断的方法在结核分枝杆菌耐药检测上为我们提供一种及时,准确,低廉,高效的检测方式,但还不能取代经典的培养法药敏试验。   第二部分:DNA分子随着温度的升高,双链解旋成为单链。这是DNA分子本身的一种性质,主要与分子的长度和GC含量等相关。这些熔解和变性特征可以用于临床研究,基因检测和法医学。高分辨熔解分析的方法借助双链结合染料对这一过程进行记录,使用特殊的软件对不同温度的荧光数据进行分析,通过熔解曲线,衍生曲线和差异曲线对DNA分子的性质进行研究。我们设计了一种针对DNA长片段突变筛查的策略。该策略结合了高分辨熔解分析和非标记探针熔解分析的优点。我们将这一方法应用到结核分枝杆菌吡嗪酰胺耐药突变的筛查中。结果显示,该体系具有高灵敏度,且可以检出野生背景中1%的突变基因。临床菌株突变筛查结果显示,该方法与测序方法的一致性为100%。  
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