在市场经济环境下，企业间的竞争归根结底是人才的竞争，如何吸引、留住、用好人才，是企业人力资源管理的核心问题。而健全的薪酬制度是吸引、激励、发展和留住人才的最有力的工具。建立科学合理的薪酬激励机制，充分发挥薪酬的激励作用，对于增强企业内部活力、实现企业的持续发展具有重要意义。本文在对经营者薪酬激励理论、绩效薪酬考核理论等薪酬管理理论的回顾的基础上，对某船公司薪酬管理制度现存问题进行了深入分析，发现某船公司子公司经营者年薪制与总部岗位效能工资制均存在着问题需要改进：子公司经营者年薪制在实施中造成经营者行为短期化、不能解决委托——代理矛盾等问题，导致各子公司经营者注重企业眼前利润而忽视企业长远发展能力，为获得较高的年薪收入竭泽而渔，提高当年营业利润，而忽视了谋划长期投资、提高研发能力、培养人才队伍等打造企业持续发展能力的工作。总部岗位效能工资制存在着绩效考核机制不完善的问题。总部每月的绩效考核对象是以部门为单位，也就是说，根据该部门当月的整体绩效给予该部门全体员工同样的奖励标准，这种平均主义、吃“大锅饭”的做法，违反了公平理论，打击了努力工作、成绩显著的员工的积极性，使他们觉得辛苦付出得不到相应回报，无法实现自身价值，从而离开公司另谋高就，对企业经营管理工作产生了不利影响，给公司带来了极大损失，造成公司人才队伍建设上出现青黄不接，企业长远发展出现困难。为改进上述问题，本文借鉴薪酬管理理论，参考国际企业和国内优秀航运企业薪酬管理制度，分析我国国内宏观政策环境，在进行充分可行性分析的基础上，研究制订了子公司经营者股份增值权计划、总部员工绩效薪酬考核体系的改进方案，以充分发挥薪酬的约束激励作用，激励经营者创造企业长期利益，使经营者的个人利益与企业的利益达成一致，提高员工在报酬分配上的公正感和满意感，从而有效调动公司经营者和员工的积极性，形成一支有创造力、竞争力的人才队伍，提高企业综合竞争能力，实现企业的持续发展。