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乙酰转移酶根据其结构和活性可分为五个大家族：①PCAF／GNAT（GNS5、PCAF、ELP3、ATF2），与酵母HAT的GCN5高度相关；②P300／CBP，转录复合物的辅助激活因子；③TAFⅡp250，基本转录复合物TAFⅡE的重要组成部分；④SRC／ACTR，配体依赖的细胞核受体辅助激活因子；⑤MYSF（MOZ、MOF、YbF2／sas3、sas2、Tip60）。