日本血吸虫尾蚴(中国大陆株)表达序列标签的获取及同源性分析

来源 :第一军医大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:q365709285
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目的了解日本血吸虫尾蚴cDNA文库中基因的基本情况,为新基因的筛选鉴定提供依据.方法日本血吸虫尾蚴cDAN文库中的噬菌体侵入大肠杆菌BM25.8后环化成质粒.筛选出已转入质粒的菌株.提取质粒DNA,用质粒上的一段测序引物序列进行一次性测序,得到一个表达序列标签(EST).通过BLASTx及BLASTn公共数据库经编辑分析的EST序列进行同源性比较.经过分析编辑后的新EST序列,以编写好的程序和E-mail方式递交,以获得GenBank登录号.通过对同源性比较结果的总结,对该文库的基本情况进行分析.结果与结论在测出的58个EST中有3个核苷酸序列与日本血吸虫已知基因高度同源,有2个核苷酸序列与曼氏血吸虫较高度同源,有7个EST的蛋白质序列与其他物种有较高同源性而核苷酸序列同源性很低,有27个EST的蛋白质及核苷酸序列同源性都很低.
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