目的对微信在基层疾病防控工作中运用的可行性做初步研究。方法以永春县的县乡部分卫生防病人员为对象,将其分为观察组和对照组。比较两组员工满意度、卫生防病知识和卫生应急APP小视频判定测试合格率;用访谈法了解微信在疾控工作中的运用价值,以及由此导致的组织沟通模式改变。结果观察组总满意度(90.6%)高于对照组(64.5%);重点传染病知识、卫生应急APP小视频判定测试合格率均高于对照组;访谈结果认为,微信对突发公共卫生应急事件的初步预判和应急处置前期准备,有重要的辅助作用,但也导致组织沟通模式和管理层级的改变。结论微信是一种即时、活泼、务实和便捷的工作方式。可利用微信开展疾病防控日常性辅助管理、卫生知识培训学习等,并可作为卫生应急处置前期的重要辅助通讯设备,但要注意相关事件的重要性、敏感性的预判和保密等工作。