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利用小样本表达谱数据构造前列腺癌基因网络
利用小样本表达谱数据构造前列腺癌基因网络
来源 :复旦学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:joshcky
【摘 要】
:
用25张前列腺癌芯片表达谱数据,基于基因间的表达相似性和基因的差异表达程度,筛选出287条基因,用模糊聚类的方法将其聚成65个类,用贝叶斯模型构造了一个大型的基因网络,并对这个
【作 者】
:
付旭平
曹明
莫文娟
姜梅
李瑶
【机 构】
:
复旦大学生命科学学院,上海市智能信息处理重点实验室
【出 处】
:
复旦学报(自然科学版)
【发表日期】
:
2010年1期
【关键词】
:
基因网络
CDNA芯片
模糊聚类
贝叶斯模型
gene network
cDNA microarray
fuzzy clustering
Bayesian
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用25张前列腺癌芯片表达谱数据,基于基因间的表达相似性和基因的差异表达程度,筛选出287条基因,用模糊聚类的方法将其聚成65个类,用贝叶斯模型构造了一个大型的基因网络,并对这个网络的有效性进行了验证.结果表明,基于本文提出的策略,利用小样本量的表达谱数据构造大型基因网络是可行的.
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