盐胁迫下秋茄根系转录组的De novo测序及分析

来源 :宁德师范学院学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:ninetails
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为从转录组水平解析秋茄的耐盐机理,分别用不同浓度NaCl处理生长60 d的秋茄幼苗,3 d后收集根系,利用Illumina HiSeq~(TM)2000平台进行转录组测序分析,共得到112 243条Transcripts和61 970条Unigenes,Transcripts与Unigenes的N50分别为2 361和1 510 bp;利用Nr、SwissProt、GO、COG和KEGG数据库对Unigenes基因进行注释,发现有26 804个Unigenes获得注释信息;对获得注释信息的Unige
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