柞蚕微孢子虫全长cDNA文库的构建及EST分析

来源 :蚕业科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:BFM_99
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
柞蚕微粒子病的病原为柞蚕微孢子虫(Nosema pernyi)。采用SMART(switching mechanism at 5’-end of RNA transcript)技术构建柞蚕微孢子虫全长cDNA文库,初始文库滴度4.2×106pfu/mL,文库容量1.0×107pfu,重组率为98.39%。随机挑取32个克隆,经PCR检测插入的片段长度在750~3 000 bp之间,平均长度>1 000 bp。挑选文库中864个克隆进行表达序列标签(EST)测序,得到626条高质量的EST,拼接后得到197条单一基因(unigenes),包含64条重叠群(contigs)和133条单一EST,冗余度为68.53%。将这些Unigenes与NCBI数据库进行比对,146条Unigenes在蜜蜂微孢子虫(Nosema ceranae)、家蚕微孢子虫(Nosema bombycis)、兔脑炎微孢子虫(Encephalitozoon cuniculi)等的基因组中比对到同源基因。在随机EST测序中克隆获得一个孢子形成蛋白(sporulation protein)基因,命名为NpSP-1。该基因ORF长度为1 014 bp,编码337个氨基酸,蛋白质的理论分子质量为39.2 kD,等电点5.71。柞蚕微孢子虫cDNA文库的构建及EST测序的完成,为进一步发现和研究柞蚕微孢子虫的功能基因奠定了基础。
其他文献
为克服当前蔬菜病害诊断专家系统依靠文字提供信息的不准确性,提出一种基于颜色特征的茄子病害图像检索方法。详细分析茄子病害图像的颜色特征,在符合人眼视觉特征的HIS颜色
财务报告舞弊是企业舞弊者通过虚增资产或利润编造虚假的财务会计报告,从而误导信息是使用者的决策。随着经济的不断发展,财务报告舞弊无论是在规模上还是违规金额上都越来越频
本文在详细研读人教版2011新课标改革后的地理教科书基础上,对初中地理的活动教学在教与学这两方面给予了较为系统的阐释。本研究的目的是在初中地理教学中活动教学的构建和应
为考察中学生家庭教养方式、自主性与一般自我效能感三者的动态关系,本研究从中学生的家庭教养方式入手对三个变量进行广泛而深入的探讨。采用随机抽样法,运用家庭教化模式量表
<正>西方经济学中有一组互不相同又互为补充的概念,那就是公共品(public goods)和私人品(private goods)。应该说"公共服务"的概念就是与其"公共品"密切相关的。可是国外研究
根据《国家人口发展功能分区技术导则》要求,在大连市人口发展功能区规划中首要进行的工作就是大连市人居环境适应性评价,而影响人居环境适宜性的诸多自然因素中,最为根本且
美国从1981年启用第一个BIT范本,之后历经数次修订,形成不同版本。其中的环境保护条款从无到有、从简到繁,2012年版本对环境保护又有大力强化。虽然环境例外条款具有法律形态
电能是当今人类社会各项活动的重要能源基础,而电能在传输的过程中不可避免的会产生一定损耗,称之为线损。线损以损失电量的多少来表示,以损失电量占供电量的百分比来衡量即为线
这几年在全国一些地方出现了一股“张五常热”。如何看待这一现象和张五常的经济观点 ?中国人民大学吴易风教授接受媒体采访时 ,就此谈了自己的看法 ,摘录如下。
根据《国家危险废物名录》(2016版)规定,废润滑油属于危险废物,代号为HW08。废润滑油产生的渠道主要有交通运输废油和工业废油两大部分,在废润滑油中所占的比重分别约为55%和